当法院发出调查令时，单位作为被调查对象，主要承担以下义务：
配合调查义务：
- 单位必须积极配合法院的调查工作，按照调查令的要求提供相关证据或资料。这包括但不限于文件、记录、账目、合同等任何可能与案件相关的材料。
- 如果单位认为调查令所要求提供的信息涉及商业秘密、个人隐私或其他敏感信息，且这些信息与案件无直接关联或提供后可能造成不必要的损害，单位可以向法院提出异议，但在法院作出最终决定前，仍应暂时保管好相关资料，不得擅自销毁或转移。
如实提供义务：
- 单位在提供证据或资料时，必须确保其真实性、完整性和准确性。不得提供虚假信息或隐瞒重要事实，以免干扰司法公正或误导法院作出错误判断。
- 如果单位发现提供的证据或资料存在错误或遗漏，应及时向法院说明情况，并补充提供正确的信息。
保密义务：
- 单位在配合法院调查过程中，接触到的案件信息、证据材料等均属于司法秘密，单位及其工作人员必须严格保密，不得向任何无关第三方泄露。
- 违反保密义务的，单位及其直接责任人员可能面临法律责任，包括但不限于罚款、拘留等，甚至可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，法院有权向有关单位和个人调查取证，有关单位和个人不得拒绝。这是保障司法公正、维护当事人合法权益的重要制度。
- 建议：对于单位而言，面对法院的调查令，应首先确认其真实性和合法性，然后积极配合调查工作。如果认为调查令的要求不合理或存在疑问，可以及时向法院沟通说明，但不得擅自拒绝或拖延提供证据。同时，单位应加强对内部信息的保密管理，防止因信息泄露而引发的法律风险。
可能后果：
- 如果单位拒绝配合法院调查或提供虚假信息，法院可以依法对其采取罚款、拘留等强制措施，并可能追究单位及其直接责任人员的法律责任。
- 在极端情况下，如果单位的违法行为构成犯罪，如帮助毁灭、伪造证据罪等，还将依法追究刑事责任。
因此，单位在面对法院调查令时，应务必谨慎对待，严格履行相关义务，以维护自身的合法权益和司法公正。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。