核心结论：驾驶他人车辆在高速被罚款1000元、扣12分，需分情况处理，具体如下：

1. 确认违法事实与责任主体
   首先需核实违法行为的真实性，包括是否为本人驾驶、违法时间地点是否与处罚决定书一致。若确认是本人驾驶，则需承担全部责任；若存在冒名顶替、车辆被套牌等情形，应立即向交警部门提出异议并申请复核，同时提供行车记录仪、监控录像等证据证明清白。

2. 处理罚款与扣分

   • 罚款缴纳：根据《道路交通安全法》第108条，需在收到处罚决定书之日起15日内，通过指定银行、交管12123APP或线下窗口缴纳罚款。逾期未缴将产生每日3%的滞纳金（最高不超过罚款本金），且可能影响车辆年检。
     
   • 扣分处理：扣12分属于严重违法，根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第68条，需在15日内参加为期7日的交通安全法律、法规和相关知识学习，并通过科目一考试。考试合格后，记分予以清除；拒不参加学习或考试的，公安机关将公告其驾驶证停止使用。

3. 对车辆所有人的影响

   • 若车辆所有人对违法不知情（如车辆被盗、被借用未告知违法），则无需承担责任。但若所有人明知驾驶人无证、酒驾等仍出借车辆，可能面临《民法典》第1209条规定的连带赔偿责任，即与驾驶人共同承担对第三方的损害赔偿。
     
   • 建议车辆所有人及时查询车辆违法记录，若发现非本人驾驶的违法，应督促实际驾驶人处理，或向交警部门说明情况，避免影响车辆年检或个人信用。

4. 后续预防措施

   • 驾驶人：扣满12分后，驾驶证将被暂扣，需重新参加科目一考试并暂扣期满后领回驾驶证。此后应严格遵守交规，避免再次扣分导致吊销驾照。
     
   • 车辆所有人：出借车辆前应核实驾驶人资质（如驾驶证状态、是否酒驾等），并签订书面借用协议，明确违法责任承担方式，降低法律风险。

行动建议：立即携带处罚决定书、驾驶证、行驶证及身份证原件，前往交警部门确认违法事实并缴纳罚款，同时预约科目一考试。若对处罚有异议，可在收到决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼。如有其他疑问，可直接向我咨询。