使用公司名义为违建房办理营业执照是不合法的，且存在多重法律风险。以下从不同角度为你详细分析：

1. 违建房本身的违法性
   根据《城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或未按许可建设的建筑，属于违法建筑。违建房自始不具备合法产权，无法通过法律程序确权，更不能作为合法经营场所使用。即使以公司名义办理营业执照，也无法改变房屋本身的违法属性，行政机关在后续监管中仍可依法查处。

2. 公司登记的审查义务
   市场监管部门在办理营业执照时，虽不直接审查房屋产权，但会要求申请人提供经营场所的合法使用证明（如房产证、租赁合同等）。若使用违建房的虚假材料（如伪造房产证或租赁合同），可能构成《公司登记管理条例》第六十四条规定的“提交虚假材料取得公司登记”，面临罚款、撤销登记甚至刑事责任。

3. 经营中的法律风险

   • 行政处罚风险：若公司实际在违建房内经营，可能被规划、城管等部门认定为“擅自改变房屋用途”或“违法建设内从事经营活动”，面临罚款、限期拆除等处罚。
     
   • 合同无效风险：若因违建房导致与第三方签订的合同（如租赁合同、合作协议）被认定无效，公司可能需承担返还财产、赔偿损失等民事责任。
     
   • 信用惩戒风险：公司若因违建问题被列入经营异常名录或严重违法失信名单，将影响企业信用、贷款、招投标等经营活动。

4. 责任承担主体
   即使以公司名义办理营业执照，若违建房系股东或实际控制人提供，且公司知情或参与违法建设，相关责任人可能需承担连带责任。例如，若违建房被强制拆除导致公司损失，股东可能需以个人财产对公司债务承担补充赔偿责任。

建议：
若房屋确属违建，应立即停止以该房屋作为经营场所的计划，并咨询专业律师评估整改或拆除方案。若需合法经营，应选择具有合法产权的房屋，并确保经营用途与规划许可一致。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情为你提供详细解决方案。