公司根据规章制度罚款是否合法，需分情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、不合法的情况
缺乏法律依据
- 罚款在一定意义上属于行政处罚权的范畴。依据《中华人民共和国行政处罚法》，行政处罚权由具有行政处罚权的行政机关实施，公司并非行政机关，不具备行政处罚的主体资格。因此，若公司直接依据自身规章制度对员工进行罚款，且没有相关法律赋予其罚款权力，该罚款行为通常是不合法的。例如，公司以员工迟到为由，直接按照规章制度罚款一定金额，若没有其他合法依据，这种罚款行为就可能违法。
规章制度制定程序不合法
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定。若公司的罚款制度未经此民主程序制定，则该制度本身不具有合法性，基于此进行的罚款也是不合法的。比如，公司未经过职工讨论，直接由管理层制定罚款制度并实施，这种制度下的罚款行为就可能存在问题。
规章制度未公示告知
- 《劳动合同法》规定，用人单位应将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示或告知劳动者。若公司仅内部发布罚款制度文件而未通过合适方式让员工知晓，则不能依据该制度对员工进行罚款。例如，公司将罚款制度放在内部网站上，但未通过邮件、公告等方式通知员工，员工声称不知道该制度，此时公司依据该制度罚款就可能不合法。
二、可能合法的情况
基于合同约定
- 若劳动合同中有明确约定，在员工出现特定违约行为时，公司有权要求员工承担一定的赔偿责任，这种赔偿性质的约定在一定程度上可能被视为合法。但需注意，扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。例如，劳动合同中约定员工若泄露公司商业秘密，需赔偿公司一定金额，当员工出现此类行为时，公司按照合同约定要求赔偿，这种赔偿性质的扣款是合法的。
- 计算公式：假设员工当月工资为W，当地月最低工资标准为M，赔偿金额为S，则赔偿金额需满足：\(S \leq 0.2W\) 且 \(W - S \geq M\)。
合法的赔偿性扣款
- 员工在工作过程中因自身过错给公司造成实际经济损失时，公司可以要求员工赔偿该损失。例如，员工违反操作规程导致设备损坏，公司可要求员工赔偿设备维修费用等实际损失。但公司需提供充分证据证明损失的存在及与员工行为的因果关系。比如，公司需要提供设备维修的发票、维修报告等证据，证明设备损坏是由于员工的过错行为导致的，且维修费用是合理的。
三、综合建议
对于公司
- 在制定和执行罚款制度时，应严格遵守相关法律法规，确保制度的合法性和有效性。首先，要确保罚款制度有法律依据，或者基于合法的合同约定；其次，要经过民主程序制定，并公示告知员工；最后，在实施罚款时，要确保罚款金额合理，不超过法定限制。
- 可以采取其他合法的管理措施来替代罚款，如警告制度、解除劳动合同、绩效考核与激励、培训与教育等。这些措施既能维护公司的正常运营和员工纪律，又能避免潜在的法律风险。
对于员工
- 应了解自身权益，对于不合法的罚款行为，有权向相关部门投诉或寻求法律援助。例如，可以向劳动监察部门投诉公司的违法行为，或者通过劳动仲裁、诉讼等方式维护自己的合法权益。
- 在签订劳动合同时，要仔细阅读合同条款，特别是关于赔偿责任和罚款的约定，确保自己的权益不受侵害。如果对合同条款有疑问，可以及时向公司提出，或者咨询专业律师。
公司在制定和执行规章制度时，应充分考虑合法性和合理性，避免滥用罚款权。员工也应了解自身权益，对于不合法的罚款行为，要勇敢维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤（劳动仲裁）的问题，可以直接向我咨询。