闯了两个红灯，驾驶证将由公安机关交通管理部门扣留。以下是详细分析：
一、法律后果与记分管理
根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的规定，驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的，一次记6分。因此，如果您在一个记分周期内连续闯了两个红灯，那么您的驾驶证将被累计记12分。当记分达到12分时，公安机关交通管理部门会依法扣留您的机动车驾驶证，这是为了对您的交通违法行为进行严肃处理，并促使您认识到自己的错误，及时改正。
二、应对措施与处理流程
接受处罚：
- 您需要尽快携带驾驶证、行驶证及身份证，前往当地交警大队或通过交警部门指定的线上渠道（如交管12123 APP）查询并处理违章记录。
- 确认违章信息后，接受处罚并缴纳相应的罚款。罚款金额通常在20元以上200元以下，具体数额会依据各地的交通法规有所不同。
参加学习与考试：
- 一旦驾驶证被扣留，您不得继续驾驶机动车上路，否则将被认定为无证驾驶，面临更严厉的处罚。
- 您需要在十五日内到机动车驾驶证核发地或违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
- 学习结束后，车辆管理所会在二十日内组织考试（科目一）。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，需继续参加学习和考试，直至合格为止。
三、特殊情况处理
对违章有异议：
- 如果您对闯红灯的违章记录有异议，可向交警部门提出行政复议。申请时需提供相关证据，如行车记录仪视频、照片等。经核实后，若确实属于可撤销的情形，违章记录将被消除。
代他人处理违章（虽不直接相关，但为全面性考虑）：
- 一辆车最多可使用三本驾驶证来处理违章，但此行为必须基于真实的驾驶行为，严禁买卖分数。根据《中华人民共和国治安管理处罚法》，伪造、隐匿、毁灭证据或提供虚假证言影响行政执法机关依法办案的，将面临五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款的处罚。
四、加强交通安全意识
闯红灯不仅违法，而且极度危险，可能导致交通事故的发生，威胁自己和他人的生命安全。因此，我建议您加强交通安全意识，严格遵守交通规则，确保行车安全。同时，要时刻关注自己的驾驶证记分情况，避免再次违章导致驾驶证被暂扣或吊销。
总之，闯了两个红灯将面临严重的法律后果，包括驾驶证扣留、罚款以及可能的学习与考试等。您应充分认识到其严重性，及时采取措施处理违章记录，并加强交通安全意识。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。