结论：欠着的5000元是否可以协商从工资里扣除，这主要取决于您与雇主之间的协商结果以及相关法律法规的规定。在符合一定条件下，这种协商是可行的。

分析说明：

1. 协商层面：

   • 首先，您需要与雇主进行坦诚的沟通，说明您目前的经济状况以及欠款的来源和原因。
   • 提出您希望从工资中扣除欠款以逐步偿还的意愿，并询问雇主是否同意这种安排。
   • 如果雇主同意，双方应签订一份书面协议，明确扣除的金额、期限以及相关的权利和义务，以避免未来可能出现的纠纷。

2. 法律法规层面：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，雇主在支付工资时应当确保工资的足额、及时支付，且不得随意克扣或拖欠。
   • 但是，如果双方达成一致，且扣除的金额和方式不违反法律法规的强制性规定（如最低工资标准等），那么这种扣除是合法的。
   • 特别需要注意的是，扣除的金额不应影响您的基本生活需求，且扣除的比例和期限应合理。

3. 实际操作建议：

   • 在与雇主协商时，您可以提出一个具体的还款计划，包括每月扣除的金额和还款期限等。
   • 确保协议中明确约定了如果因特殊情况（如生病、失业等）导致无法按时还款时的处理方式。
   • 保留好与雇主协商的书面记录或协议，以备未来可能出现的纠纷时作为证据。

特殊场景：

• 如果欠款是由于雇主的原因造成的（如未按时支付工资、未报销费用等），那么您有权要求雇主直接支付欠款，而不是从工资中扣除。
• 如果雇主不同意从工资中扣除欠款，您可能需要考虑其他还款方式，如分期还款、寻求第三方帮助等。

后续行动与注意事项：

• 在协商过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的冲突。
• 如果协商无果或雇主存在违法行为（如恶意拖欠工资、非法克扣等），您可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
• 在整个过程中，注意保护自己的合法权益，不要因急于还款而忽视了自己的基本权益。

计算公式（如适用）：

• 在此场景中，由于主要涉及的是协商和法律法规的适用，因此没有具体的计算公式。但如果您需要计算每月应扣除的金额或还款期限等，可以根据您的实际情况和与雇主的协商结果来制定。

总结与建议：

欠着的5000元是否可以协商从工资里扣除，取决于您与雇主之间的协商结果以及相关法律法规的规定。在协商过程中，建议您保持冷静和理性，明确提出自己的还款计划和意愿，并确保协议中明确约定了相关的权利和义务。如果协商无果或遇到法律问题，请及时向我咨询或寻求法律援助。