关于农村自建房是否需要四邻签字协议的问题，这主要取决于当地的政策法规以及具体的规划要求。
首先，从一般原则来说，农村自建房在规划、建设过程中，确实需要考虑到与周边环境的协调性，以及尊重相邻土地使用权人的权益。因此，在很多地区，村民在申请自建房时，会被要求征询相邻土地使用权人（即四邻）的意见。
具体到是否需要四邻签字协议，这并非全国统一的规定，而是因地区而异。例如，根据《北京市城乡规划条例》的相关规定，在规划农村地区，村民使用宅基地进行住宅建设时，应当征询相邻土地使用权人的意见，并经过村民委员会审议后上报乡镇人民政府批准。这里的“征询意见”并不等同于必须获得四邻的签字同意，但实际操作中，为了确保顺利审批和减少后续纠纷，很多地方会要求申请人尽量与四邻达成一致，甚至在某些情况下需要四邻签字确认。
如果四邻意见不一致，这并不意味着申请人就不能建房。根据相关规定，如果四邻意见不一致，村委会会形成是否同意其建房的决议。这意味着，最终是否批准建房，会综合考虑多方面的因素，包括但不限于四邻的意见、申请人的宅基地使用权、建房是否符合规划要求等。
因此，我的建议是：
在申请农村自建房前，先了解清楚当地的政策法规和规划要求，特别是关于是否需要征询四邻意见以及如何处理四邻意见不一致的情况。
尽量与四邻进行友好沟通，争取达成一致意见。这不仅可以减少后续纠纷，也有助于顺利获得审批。
如果四邻意见不一致，不要过于担心。按照当地的规定和程序，向村委会提出书面申请，并准备好相关的证明材料和施工图纸等。村委会会根据实际情况进行审议，并形成是否同意建房的决议。
总之，农村自建房是否需要四邻签字协议并没有一个固定的答案，而是需要根据当地的政策法规和规划要求来确定。在申请过程中，保持与四邻的良好沟通，并遵循当地的规定和程序，是确保顺利建房的关键。