针对“耕地违建20多年怎么处理”这一问题，核心结论需结合法律时效性、土地管理法规及行政执法实践综合判断，具体分情况说明如下：

1. 违法建筑的法律定性不受时间影响
   根据《土地管理法》第七十七条，未经批准非法占用土地建住宅或其他建筑物的，均属违法行为。违法状态持续存在（即建筑物未拆除或未恢复土地原状）的，不受20年时效限制，行政机关仍有权依法查处。实践中，即使违建存在超过20年，只要未通过合法程序补办用地手续，仍可能被认定为违法建筑。

2. 行政处罚与拆除的可能性

   • 若违建未补办手续：自然资源部门可依据《土地管理法》第七十七条作出行政处罚，责令限期拆除、恢复土地原状，并可并处罚款（按非法占用土地面积每平方米100元以下标准）。
     
   • 若违建已补办手续：若通过缴纳罚款、补办用地审批等方式“合法化”，则不再属于违建，但需符合当时政策条件（如历史遗留问题处理政策）。
     
   • 特殊情形：若违建涉及基本农田，根据《基本农田保护条例》第十七条，处罚力度更严，可能面临强制拆除且无补偿。

3. 历史遗留问题的处理原则
   对1987年《土地管理法》实施前建设的房屋，若符合“一户一宅”且未扩大面积，部分地区可能通过确权登记或补办手续予以合法化；但1987年后建设的违建，需严格依法处理。20年时间本身不构成免责理由，但行政机关在执法时可能考虑建筑实际使用情况（如唯一住房、社会稳定因素），采取“逐步整改”或“罚款保留”等灵活措施。

4. 行政诉讼的救济途径
   若对处罚决定不服，当事人可在收到决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼。法院会审查行政机关的执法程序（如是否超过追诉时效、是否听取陈述申辩等），但违法状态持续存在通常不构成程序违法抗辩理由。

建议行动：

• 立即核查违建是否已补办用地手续（如乡村建设规划许可证、宅基地使用证等）；
  
• 若未补办，主动联系当地自然资源部门或乡镇政府，咨询历史遗留问题处理政策；
  
• 保留建筑建设时间、用途（如自住）等相关证据，以备后续协商或诉讼使用。
  

如有进一步细节（如违建用途、所在地区政策等），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。