结论：在当事人不在了的情况下起诉第三者，第三者是否会留案底，取决于第三者是否被法院判决有罪。若第三者未被判决有罪，则不会留案底；若被判决有罪，则会留案底。

分析说明：

1. 案底的定义：

   • 案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后，所留下的官方记录。这种记录会伴随个人一生，并在特定情况下（如求职、出国等）可能被查询和考虑。

2. 起诉与判决的关系：

   • 起诉是刑事诉讼程序的开始，它并不直接决定一个人是否有罪。起诉只是表明，有证据认为某人可能犯了罪，需要法院进行审理和判决。
   • 判决是法院根据审理过程中查明的事实和适用的法律，对被告人是否犯罪以及应受何种刑罚所作出的决定。只有法院判决有罪，才会产生案底。

3. 当事人不在了的情况：

   • 当事人不在了，可能指的是当事人死亡或无法参与诉讼程序。在这种情况下，诉讼程序可能会继续进行，特别是如果案件涉及公共利益或需要查明事实真相。
   • 然而，当事人的不在并不影响法院对第三者的审理和判决。法院将根据证据和法律，独立、公正地作出判决。

4. 第三者是否会留案底：

   • 如果第三者被法院判决有罪，那么根据案底的定义，第三者将会留下案底。
   • 如果第三者未被判决有罪（例如，因证据不足被无罪释放或法院判决无罪），则不会留下案底。

特殊场景：

• 在某些情况下，即使当事人不在了，案件也可能因为涉及公共利益、需要保护其他受害者或查明事实真相而继续进行。此时，第三者的行为如果构成犯罪，仍然可能被法院判决有罪并留下案底。

行动建议：

• 如果您面临类似情况，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能的结果。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。
• 同时，保持对案件进展的关注，及时了解法院的判决结果，以便采取相应的措施。

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