结论：男方起诉离婚后，双方在法院作出离婚判决且判决生效之前，仍可以合法共同居住；但判决生效后，若无特殊协议，继续共同居住可能引发法律问题。以下是对此问题的详细分析：

一、法律程序期间的居住权

1. 法律关系存续：起诉离婚仅代表一方向法院提起了解除婚姻关系的诉讼，在法院作出离婚判决且该判决生效前，夫妻关系在法律上依然有效。因此，这段时间内双方共同居住并不违反法律规定。例如，若房屋为夫妻共同财产，或一方婚前财产但双方有居住约定，则任何一方均有权在家中居住。
2. 判决生效后的变化：一旦法院判决离婚且判决生效，双方的婚姻关系即告解除。此时，若无特殊协议（如分居协议中明确双方可继续共同居住至特定时间），继续共同居住可能会涉及同居关系的认定及相关权利义务的处理，可能产生新的法律问题，如财产混同、债务承担等。

二、实际情况与协商的重要性

1. 关系紧张与冲突：尽管法律上允许共同居住，但实际生活中，双方关系可能已经十分紧张。继续共同居住可能加剧矛盾，甚至导致更多冲突和纠纷，不利于离婚诉讼的顺利进行。
2. 协商解决问题：为避免不必要的纷争，双方应通过协商来确定居住安排。例如，可以暂时分居，或就共同住所的使用达成其他协议，如一方居住主卧，另一方居住次卧，并明确各自的使用区域和时间等。这样的协商有助于缓解紧张气氛，为离婚诉讼的顺利进行创造条件。

三、法律建议与注意事项

1. 安全考虑：在决定是否继续与男方共同居住时，女方应首要考虑自己的安全和舒适感。如感到不安全或受到威胁，应立即寻求法律帮助，如向法院申请人身安全保护令等。
2. 和平解决：双方应尽可能以和平方式解决居住问题，避免加剧离婚诉讼的紧张氛围。协商不成时，可寻求律师或法律机构的调解，以达成双方都能接受的居住安排。
3. 财产与债务处理：若选择继续共同居住，应妥善处理共同居住期间的财产和债务问题。例如，可以签订书面协议，明确各自在共同居住期间的财产权益和债务承担方式，避免混同状态导致的难以界定和后续纠纷。
4. 避免重婚情形：在离婚诉讼期间及判决生效后，双方均应注意避免构成重婚情形。即一方在未解除婚姻关系的情况下与他人以夫妻名义共同生活，否则将承担相应的法律责任。

额外提醒：起诉离婚期间是否继续共同居住，需根据双方的具体情况和意愿来决定。在做出决策时，双方应理性、客观地分析利弊，以做出最符合自己利益的决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。