结论：在起诉离婚期间，是否选择分居需根据双方具体情况和需求来决定，分居与不分居各有其利弊。以下是对此问题的详细分析：
分居的利弊分析
分居的益处
- 冷静思考：分居可以为双方提供一个冷静处理彼此关系的机会，避免在同一屋檐下因日常琐事产生更多冲突和矛盾。这有助于双方更加客观地思考婚姻问题，评估是否有继续下去的必要。
- 感情认定：持续、稳定的分居事实可以作为法院判断夫妻感情是否确已破裂的重要参考。特别是当双方因感情不和分居满两年且调解无效时，法院通常会准予离婚。
- 财产与债务处理：分居期间，夫妻各自的财产收入、债务承担等情况可能会发生变化。明确分居期间的财产和债务归属，有助于后续夫妻共同财产的界定、个人财产范围的确定以及债务的分配。
分居的潜在风险
- 子女抚养问题：分居可能导致子女抚养安排变得复杂，需要双方协商确定子女的居住、教育等事宜，并确保子女的权益不受损害。
- 社会舆论压力：在某些社会环境中，分居可能引发外界对婚姻状况的猜测和议论，给双方带来一定的心理压力。
- 法律程序复杂性：虽然分居本身不直接等同于离婚，但在后续离婚诉讼中，分居事实的证明和认定可能增加法律程序的复杂性。
不分居的利弊分析
不分居的益处
- 便于沟通协商：共同居住有助于双方保持沟通，便于就离婚事宜进行协商和谈判，可能更快达成共识。
- 减少子女心理影响：对于有子女的家庭来说，不分居可以减少子女因父母分居而产生的心理压力和不安感。
- 避免社会舆论：不分居可以避免外界对婚姻状况的过度关注和猜测，减少不必要的心理压力。
不分居的潜在风险
- 冲突升级：如果双方感情已经破裂且无法调和，继续共同居住可能导致冲突进一步升级，甚至引发暴力等极端行为。
- 财产混同风险：不分居期间，双方财产可能继续混同，增加后续财产分割的难度和复杂性。
操作建议
如果选择分居
- 协商约定：双方应对分居的相关事宜进行协商约定，包括但不限于分居时间、财产分割（特别是分居期间新取得的财产）、子女抚养安排等。
- 保存证据：注意保存好相关证据，如租房合同、居委会证明等，以证明分居的事实和时间。
- 履行义务：分居期间，双方仍然需要履行相应的婚姻义务，如抚养子女、赡养老人等。
如果选择不分居
- 保持冷静：尽量保持冷静和理智，避免情绪化的冲突和争吵。
- 明确界限：在共同居住期间，可以明确各自的生活空间和财务界限，减少不必要的摩擦和纠纷。
- 积极协商：就离婚事宜进行积极协商和谈判，争取达成共识并尽快解决婚姻问题。
总结：在起诉离婚期间，是否选择分居需根据双方具体情况和需求来决定。无论选择分居还是不分居，双方都应保持冷静和理智，积极协商解决婚姻问题，并确保子女的权益不受损害。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。