保护动物飞到家里，一般由野生动物保护主管部门管理，依据是《中华人民共和国野生动物保护法》等相关法律法规。具体分析如下：

1. 管理部门的确定：

   • 根据《中华人民共和国野生动物保护法》第七条，国务院林业草原、渔业主管部门分别主管全国陆生、水生野生动物保护工作。县级以上地方人民政府林业草原、渔业主管部门分别主管本行政区域内陆生、水生野生动物保护工作。这意味着，对于飞到家里的保护动物，无论是陆生还是水生，都应由相应的林业草原或渔业主管部门负责管理。
   • 在实际操作中，如果保护动物飞到居民家中，居民可以首先联系当地的野生动物保护机构、林业部门或渔业部门（根据动物类型选择），或者拨打110报警电话，由警方协调相关部门前来处理。

2. 管理依据：

   • 《中华人民共和国野生动物保护法》：该法明确规定了野生动物的保护、管理、利用和法律责任等方面的内容。对于飞到家里的保护动物，相关部门会依据该法进行妥善处理，如救助、放生或安置等。
   • 其他相关法规：除了《野生动物保护法》外，还有《中华人民共和国陆生野生动物保护实施条例》、《中华人民共和国水生野生动物保护实施条例》等法规，也对野生动物的保护和管理提供了具体的法律依据。

3. 居民应如何做：

   • 当保护动物飞到家里时，居民应保持冷静，不要惊扰或伤害动物。
   • 尽快联系当地的野生动物保护机构、林业部门或渔业部门，或者拨打110报警电话，报告情况并请求协助。
   • 在等待相关部门到来期间，可以尽量为动物提供一个安全、安静的环境，避免其受到进一步的惊吓或伤害。

4. 特殊情况处理：

   • 如果飞到家中的保护动物具有攻击性或可能对人类造成危害，居民应在确保自身安全的前提下，采取必要的防护措施，并尽快联系相关部门前来处理。
   • 对于因特殊原因需要暂时收留保护动物的情况，居民应咨询相关部门并遵循其指导进行操作，以确保动物的福利和安全。