诉讼开始后，若发现被告公司进行了减资，可采取以下措施来维护自身合法权益：

1. 立即收集并固定证据：

   • 减资公告：获取被告公司发布的减资公告，包括公告的发布时间、内容等，以证明减资行为的存在。
   • 股东会决议：收集被告公司股东会关于减资的决议文件，了解减资的具体方案、比例及实施时间等。
   • 工商变更登记：查询被告公司的工商变更登记记录，确认减资是否已完成工商登记，以及减资后的注册资本情况。
   • 财务报告：如果可能，获取被告公司减资前后的财务报告，分析减资对公司偿债能力的影响。

2. 评估减资行为对诉讼的影响：

   • 偿债能力下降：如果减资导致被告公司的偿债能力显著下降，可能影响到其履行判决的能力，此时需考虑采取进一步的法律措施来保障债权。
   • 恶意减资：若减资行为存在恶意，如为了逃避债务而进行的减资，可能构成滥用公司法人独立地位和股东有限责任，此时可追究股东的连带责任。

3. 向法院申请财产保全或行为保全：

   • 财产保全：如果担心被告公司减资后财产减少，影响判决的执行，可以向法院申请财产保全，冻结被告公司的银行账户、查封其财产等。
   • 行为保全：在特定情况下，如减资行为正在实施且可能对债权人造成不可逆转的损害时，可以向法院申请行为保全，要求被告公司停止减资行为。

4. 在诉讼中主张减资行为的违法性：

   • 如果减资行为违反了公司法、合同法等相关法律法规的规定，如未按照法定程序进行减资、未通知债权人等，可以在诉讼中主张该减资行为无效或可撤销。
   • 要求法院在判决中考虑减资行为对被告公司偿债能力的影响，并据此调整判决结果，如增加赔偿金额、要求股东承担连带责任等。

5. 考虑追加股东为被告：

   • 如果减资行为导致被告公司无法清偿债务，且股东存在过错或滥用权利的情况，可以考虑在诉讼中追加股东为被告，要求其承担相应的法律责任。

6. 关注减资后的公司动态：

   • 持续关注被告公司的经营状况、财务状况及减资后的动态，以便及时调整诉讼策略或采取进一步的法律措施。

行动建议：

• 尽快与律师沟通，详细了解案件情况，制定具体的诉讼策略。
• 根据律师的指导，及时收集并固定相关证据，为诉讼做好充分准备。
• 密切关注案件进展，根据情况变化及时调整诉讼策略或采取进一步的法律措施。

在处理此类案件时，务必保持谨慎和冷静，遵循法律程序，以最大限度地维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。