责令限制生产、停产整治确实属于行政处罚的一种。以下是对这一结论的详细解释和分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国行政处罚法》第九条的规定，行政处罚的种类明确包括“限制开展生产经营活动、责令停产停业、责令关闭、限制从业”等情形。这一法律条款为责令限制生产、停产整治作为行政处罚提供了明确的法律依据。
二、定义与性质
责令限制生产、停产整治是指行政机关对违反行政管理法规的企业法人、非企业经济实体或个体经营户，依法在一定期限内剥夺或限制其从事某项生产经营活动的资格。这种处罚并不剥夺被处罚人的固有权利，而是对其特定行为能力进行暂时性的限制，属于行政处罚中的行为罚类别，也称为能力罚。
三、目的与适用情形
目的：责令限制生产、停产整治的主要目的是纠正违法行为，促使被处罚人进行整改，以严格依法生产经营。通过暂停或限制其生产经营活动，避免违法行为继续造成危害，同时给予其改正的机会，以达到规范市场秩序、维护公共利益的效果。
适用情形：这种处罚通常适用于生产经营者实施了比较严重的违法行为，且违法行为后果严重，特别是涉及人们生命健康安全的领域（如药品、食品等）。在这些情况下，行政机关可能会采取责令限制生产、停产整治的措施来纠正违法行为并防止进一步危害的发生。
四、特点
惩戒性：责令限制生产、停产整治是对违法行为的直接惩戒，通过暂时中止或限制被处罚人的生产或经营活动来体现法律的严肃性和权威性。
暂时性：此处罚并不永久剥夺被处罚人的生产经营权利，而是暂时性地中止或限制其活动，待其整改合格后方可恢复。
不剥夺权利资格：虽然暂停或限制了生产经营活动，但被处罚人已获得的权利资格并未被剥夺，仍有改正后继续经营的可能。
五、程序要求
在作出责令限制生产、停产整治的行政处罚决定之前，行政机关必须遵循严格的程序要求，包括告知听证权利、组织听证等，以确保当事人的合法权益得到充分保障。
六、与行政强制措施的区别
值得注意的是，责令限制生产、停产整治作为行政处罚的一种，与行政强制措施有着明显的区别。行政强制措施通常是为了制止违法行为、防止证据损毁或避免危害发生而采取的临时性、紧急性措施，如限制公民人身自由、查封场所等。而责令限制生产、停产整治则是对已经发生的违法行为进行的惩戒，旨在纠正错误并促进合法经营。
总结与建议：
责令限制生产、停产整治是一种具有明确法律依据、特定适用情形和严格程序要求的行政处罚措施。它通过对违法者特定行为能力的暂时限制或剥夺，达到纠正违法行为、维护市场秩序和保护公共利益的目的。如果您或您的企业面临此类行政处罚，建议及时咨询专业律师（即我本人，方宏图律师），了解具体的法律程序和应对策略，以维护自身合法权益。