针对您已经还清逾期助学贷款但系统仍显示逾期的问题，这通常是由于系统更新延迟或信息同步问题导致的，您可以按照以下步骤来处理：

1. 确认还款事实：

   • 首先，请确保您已经确实还清了所有逾期的助学贷款，包括本金、利息以及可能产生的罚息或滞纳金。您可以通过查看银行还款记录、转账凭证或贷款机构的还款确认函来确认这一点。

2. 联系贷款机构：

   • 接下来，您应立即联系发放助学贷款的机构（如银行、教育部门或相关金融机构），向他们说明您已经还清贷款但系统仍显示逾期的情况。
   • 提供还款凭证和相关证据，要求贷款机构核实并更新您的还款状态。

3. 要求系统更新：

   • 贷款机构在核实您的还款情况后，应会尽快更新其系统，将您的还款状态从“逾期”更改为“已还清”。
   • 如果贷款机构表示需要一定时间来处理，您可以询问具体的时间框架，并要求他们在处理完成后通知您。

4. 关注信用记录：

   • 由于逾期记录可能会影响您的个人信用，因此在系统更新后，您应关注自己的信用记录，确保逾期记录已被正确删除或更新。
   • 您可以通过中国人民银行征信中心或其他合法的信用查询机构来查询自己的信用报告。

5. 保留证据以备不时之需：

   • 在整个过程中，请务必保留好所有与还款和沟通相关的证据，如还款凭证、转账记录、与贷款机构的沟通记录等。
   • 这些证据在将来可能用于证明您的还款情况，特别是在出现信用纠纷时。

6. 考虑法律途径（如必要）：

   • 如果贷款机构长时间未更新系统，且您的信用记录因此受到严重影响，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 在这种情况下，您可以咨询我，了解具体的法律程序和可能的赔偿方案。

额外建议：

• 在处理此类问题时，保持耐心和冷静是非常重要的。系统更新和信息同步可能需要一定时间，因此请给予贷款机构合理的处理时间。
• 同时，定期查看自己的信用报告是一个好习惯，这有助于您及时发现并处理任何可能的信用问题。

如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我专注于经济纠纷和婚姻家庭领域，能够为您提供专业的法律建议和支持。