公司出台绩效考核扣员工工资，在符合法律规定的条件下是合法的，但若违反相关法律规定则不合法。以下是对此问题的详细分析：
合法情形及条件
制度依据：
- 公司应制定明确的绩效考核制度和薪酬管理制度，这些制度需经过民主程序（如职工代表大会或全体职工讨论）制定，并向劳动者公示或告知。绩效考核制度应明确考核标准、考核周期、考核结果的应用等关键内容。
- 举例：若公司制定了详细的绩效考核制度，明确了考核标准、考核周期以及绩效工资的扣减规则，并且这些制度已经过职工代表大会讨论通过，同时向员工进行了公示或告知，那么公司根据这些制度扣减绩效工资是合法的。
合同约定：
- 用人单位与劳动者签订的劳动合同中应明确约定绩效工资的发放条件和扣减规则。若劳动合同中有“因劳动者未能达到绩效考核标准，用人单位可以扣减绩效工资”的类似条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，则公司有权根据绩效考核结果扣减工资。
- 举例：劳动合同中明确约定，若员工绩效考核不达标，公司有权扣减其绩效工资的10%。在此情况下，公司按照合同约定扣减工资是合法的。
合理性与公正性：
- 绩效考核过程应公开透明，确保考核结果的客观性和公正性。扣减工资的比例和幅度应合理，避免过度扣减导致劳动者收入过低。
- 举例：公司在进行绩效考核时，应确保考核标准明确、考核过程公正，且扣减工资的比例应合理，如不超过员工当月工资的20%。若公司随意扣减工资，且扣减比例过高，则可能构成违法。
法律底线：
- 扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。扣减工资的行为不得违反《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的规定。
- 举例：若员工当月工资为3000元，公司扣减绩效工资后，其实际工资不得低于当地最低工资标准（如2000元）。若扣减后工资低于最低工资标准，则公司行为构成违法。
不合法情形及后果
无制度或合同依据：
- 若公司未制定绩效考核制度或未在劳动合同中约定绩效工资的扣减规则，则公司无权擅自扣减劳动者的工资。
- 后果：劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补发工资并承担相应的法律责任。
考核过程不公正：
- 若绩效考核过程存在主观臆断、暗箱操作等行为，导致考核结果不公正，则公司基于该结果扣减工资的行为可能被视为违法。
- 后果：劳动者同样有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
违反法律底线：
- 若扣减后的工资低于当地最低工资标准，或扣减行为违反了其他法律法规的强制性规定，则公司的行为构成违法。
- 后果：公司不仅需要补发工资，还可能面临劳动监察部门的处罚。
滥用绩效考核扣工资：
- 公司不得以绩效考核为手段进行恶意扣减或无故克扣工资，如为降低成本而故意将大部分员工评定为不达标并扣绩效工资。
- 后果：这种行为不仅违法，还会损害公司的声誉和员工的积极性，导致员工流失和团队不稳定。
建议与总结
- 对于公司：应制定合法、明确、合理的绩效考核制度和薪酬管理制度，并确保这些制度经过民主程序制定并向员工公示或告知。同时，公司应确保绩效考核过程公正、透明，扣减工资的比例和幅度合理，且扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
- 对于员工：若认为公司绩效考核扣工资的行为不合法，首先应尝试与公司进行协商沟通；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。
总之，公司出台绩效考核扣员工工资是否合法，取决于多个因素的综合考量。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。