协议股东起诉公司想撤销出资，这一行为是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
一、股东出资的法定性
股东出资是公司设立和运营的基础，也是股东对公司承担有限责任的前提。根据《公司法》的相关规定，股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东出资后，其出资即成为公司的财产，股东不得随意抽回。因此，一般情况下，股东不能单方面要求撤销出资。
二、股东撤销出资的合法情形
尽管股东出资具有法定性，但在某些特定情形下，股东可能有权要求撤销出资或获得相应补偿：
出资协议存在瑕疵：如果股东与公司之间的出资协议存在重大误解、显失公平或欺诈等情形，股东可能有权依据《民法典》中关于合同撤销的规定，请求法院撤销出资协议，并要求返还出资。但这种情况较为罕见，且需要股东提供充分的证据证明出资协议存在瑕疵。
公司未履行相关义务：如果公司未按照出资协议或公司章程的约定，为股东提供相应的权益或服务，股东可能有权要求公司承担违约责任，并在一定条件下要求撤销出资或获得补偿。但这同样需要股东提供充分的证据证明公司未履行相关义务。
公司解散或清算：在公司解散或清算的情况下，股东有权按照其出资比例分配公司的剩余财产。如果股东在公司解散或清算前已经出资，但公司未按照法定程序进行清算或分配剩余财产，股东可能有权要求公司返还其出资或获得相应补偿。但这种情况下的“撤销出资”实际上是通过清算程序实现的，而非单方面要求撤销。
三、股东撤销出资的法律程序
如果股东认为存在上述合法情形之一，并希望撤销出资，应当遵循以下法律程序：
与公司协商：首先，股东可以尝试与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
提起诉讼：如果协商无果，股东可以向法院提起诉讼，请求法院撤销出资协议或要求公司返还出资。在诉讼过程中，股东需要提供充分的证据证明其主张的合法性。
执行判决：如果法院支持股东的诉讼请求，股东可以依据法院的判决要求公司返还出资或获得相应补偿。如果公司拒不履行判决，股东可以申请法院强制执行。
四、法律建议
审慎评估：股东在考虑撤销出资前，应当审慎评估自身情况的合法性和可行性，避免盲目行动导致不必要的法律风险。
咨询专业律师：由于股东撤销出资涉及复杂的法律问题和程序，建议股东在行动前咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障。
保留证据：股东在协商或诉讼过程中，应当注意保留相关证据，如出资协议、公司章程、付款凭证等，以证明其主张的合法性。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。