市场监管部门进行并案处理的主要法律依据为《市场监督管理行政处罚程序规定》第二十条，具体分析如下：

1. 核心法律依据
   根据《市场监督管理行政处罚程序规定》第二十条，经核查，有下列情形之一的，可以合并立案：

   • 同一经营主体实施的多个违法行为；
     
   • 多个关联经营主体共同实施的违法行为；
     
   • 违法行为涉及多个地区，需要由市场监管部门统一协调处理的。
     该条款明确赋予市场监管部门在符合条件时合并立案的权限，旨在提高执法效率、避免重复调查，同时确保对关联违法行为的全面查处。

2. 并案处理的实质条件
   并案需满足“关联性”要求，包括：

   • 主体关联：如同一企业分支机构或母子公司共同违法；
     
   • 行为关联：如同一违法行为涉及多个环节（生产、销售、宣传）；
     
   • 地域关联：如跨区域违法行为需统一调查标准。
     例如，某企业同时在多个省份销售不合格产品，市场监管总局可指定省级部门合并立案，避免各地处罚标准不一。

3. 程序保障与当事人权利

   • 告知义务：并案后需向当事人送达《合并立案通知书》，说明理由及法律依据；
     
   • 陈述申辩权：当事人有权对并案处理提出异议，市场监管部门需复核并答复；
     
   • 救济途径：若认为并案违法，当事人可在行政处罚决定作出后，通过行政复议或诉讼主张权利。

4. 实践中的典型场景

   • 系列案件：如某品牌连锁店多家门店存在价格欺诈，可合并立案统一处罚；
     
   • 复杂案件：如网络传销涉及技术开发、资金结算、宣传推广等多环节，需合并调查；
     
   • 跨区域案件：如某电商平台允许商家销售侵权商品，需多地市场监管部门协同并案。

提示：若您遇到市场监管部门并案处理的具体案件，可进一步提供细节（如涉及行业、违法行为类型等），我将结合《行政处罚法》《反不正当竞争法》等相关法规，为您分析程序合法性及应对策略。