质保金退还的计算方式需根据合同中约定的多种质保期条款综合判断，核心原则是“按最晚到期质保期确定退还时间，但需扣除已到期质保期对应的责任金额”（如有）。 以下是具体分析：

1. 合同明确约定“分阶段退还”的，按约定执行

若合同中针对不同质保期（如设备质保期、安装质保期、材料质保期等）分别约定了质保金比例及退还时间（例如：设备质保期2年，退还50%质保金；安装质保期1年，退还30%质保金），则需按约定分阶段退还。
关键点：

• 需核对合同中是否明确区分了不同质保期对应的质保金比例；
  
• 若某阶段质保期内出现质量问题，发包方有权扣留对应比例的质保金直至修复完成。

2. 合同未明确分阶段，但存在多个质保期的，以“最晚到期质保期”为退还节点

若合同仅约定“质保金在质保期满后退还”，但未区分不同质保期对应的金额，而实际存在多个质保期（如设备质保期2年、安装质保期1年），则通常以最晚到期的质保期（即2年）作为质保金全额退还的时间节点。
例外情形：

• 若发包方能证明某部分质保金对应的是已到期的较短质保期（如安装部分），且该部分无质量问题，可主张提前退还对应金额；
  
• 若承包方同意，也可通过补充协议提前退还部分质保金。

3. 质保期内出现质量问题的，退还时间顺延或扣减金额

无论合同如何约定，若在任一质保期内出现质量问题且承包方未及时修复，发包方有权：

• 顺延退还时间：直至质量问题修复且质保期重新计算期满；
  
• 扣减质保金：直接从质保金中扣除修复费用，剩余部分退还（需保留书面证据）。

4. 实务建议

• 合同审查：签订合同时，务必明确约定不同质保期对应的质保金比例、退还条件及时间节点，避免歧义；
  
• 过程管理：质保期内定期检查并留存书面记录，出现质量问题及时修复并要求发包方确认；
  
• 争议解决：若发包方无故扣留质保金，可依据合同约定通过协商、诉讼或仲裁主张权利。

总结：质保金退还的核心是“合同约定优先，无约定时以最晚质保期为准，但需扣除质量问题对应的金额”。具体操作需结合合同条款及实际履约情况判断，如有疑问可进一步提供合同细节，我会为您详细分析。