企业合同诈骗立案后，责任承担问题需从单位责任和个人责任两个主要角度进行分析：
一、单位责任
单位作为犯罪主体：
- 当企业以单位名义实施合同诈骗行为，且违法所得归单位所有时，该企业构成单位犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，单位犯合同诈骗罪的，对单位判处罚金，罚金数额依据犯罪情节决定。
- 司法机关在认定单位犯罪时，会综合考虑诈骗行为是否由单位决策机构决定、是否以单位名义实施、违法所得是否归单位所有等因素。
单位责任的具体表现：
- 除了被判处罚金外，单位还可能面临其他行政处罚，如吊销营业执照、责令停业整顿等。
- 同时，单位需积极配合司法机关进行后续整改，完善内部管理机制，以防止类似诈骗行为的再次发生。
二、个人责任
直接负责的主管人员和其他直接责任人员：
- 在单位合同诈骗中，对诈骗行为负有决策、组织、指挥等关键作用的公司领导或管理人员（如法定代表人、部门经理等），以及具体实施诈骗行为的人员（如业务员、经办人员等），均应承担相应的刑事责任。
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百二十四条的规定，个人犯合同诈骗罪，根据诈骗数额和情节严重程度，可能面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金的处罚；数额巨大或有其他严重情节的，可能面临三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金的处罚；数额特别巨大或有其他特别严重情节的，甚至可能面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产的处罚。
个人责任的具体判定：
- 在判定个人责任时，司法机关会综合考虑个人在单位犯罪中的地位、作用、行为与犯罪结果之间的因果关系等因素。
- 直接负责的主管人员通常指在单位犯罪中起决定、批准、授意、纵容、指挥等关键作用的人员；其他直接责任人员则指在单位犯罪中具体实施犯罪行为并起到较大作用的人员。
三、特殊情况下的责任承担
个人独立犯罪：
- 如果公司员工以个人名义实施合同诈骗行为，并非代表公司，且违法所得也归个人所有，则该员工需独立承担合同诈骗的刑事责任。此时，公司与该员工的犯罪行为无关，不承担任何责任。
民事赔偿责任：
- 无论是单位犯罪还是个人犯罪，受害者都有权要求实施诈骗行为的主体承担民事赔偿责任。这包括赔偿被害人因被骗而遭受的经济损失。
- 受害者可以通过刑事附带民事诉讼的方式，向法院提起诉讼，要求相关责任人和/或单位进行赔偿。
四、实际应用中的建议
企业应加强内部管理：
- 企业应建立健全的内部管理机制，加强对员工的教育和培训，提高员工的法律意识和风险防范能力。
- 同时，企业应定期对合同进行审查和管理，确保合同的合法性和有效性。
个人应遵守法律法规：
- 个人在签订和履行合同时，应遵守法律法规和道德规范，不得利用合同进行诈骗等违法行为。
- 一旦发现被骗或涉嫌诈骗行为，应及时向公安机关报案并配合调查取证工作。
总结来说，企业合同诈骗立案后，责任承担问题需综合考虑单位责任和个人责任。单位可能面临罚金等刑事处罚以及行政处罚；直接负责的主管人员和其他直接责任人员则可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑事处罚。同时，受害者还有权要求实施诈骗行为的主体承担民事赔偿责任。如果您或您的企业面临类似问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。