非法营运行为主要由县级以上道路运输管理机构负责管理和处罚，交警部门在特定情况下会予以协助。以下是对这一问题的详细分析：

一、非法营运的定义与性质

非法营运是指未依法取得营运权而擅自从事道路运输经营的行为，即未按规定领取有关主管部门核发的营运证件或超越核定范围进行经营。这种行为不仅扰乱了正常的道路运输市场秩序，还可能对乘客的安全构成严重威胁。

二、各部门职责分工

1. 交警部门：

   • 主要职责是维护道路交通秩序，保障道路交通安全，处理交通事故等与道路通行安全直接相关的事务。
   • 负责查处机动车驾驶员的交通违法行为，如闯红灯、超速、酒驾等。
   • 在执勤过程中，交警可能会发现并处理一些涉嫌非法营运的车辆，但这并非其主要职责。

2. 交通运输部门（道路运输管理机构）：

   • 负责对道路运输市场进行监管，包括非法营运行为的查处。
   • 目的是规范运输市场秩序，保障合法经营者的权益，以及乘客的安全和利益。
   • 负责审核和管理客运车辆、货运车辆的营运资质，监督运输企业和从业人员遵守相关规定。

三、非法营运的执法依据与管理措施

• 相关法律法规：根据《中华人民共和国道路运输条例》的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的行为属于非法营运。
• 处罚措施：
  • 有违法所得的，没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
  • 没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款。
  • 构成犯罪的，依法追究刑事责任。
• 管理与执行：由县级以上道路运输管理机构负责责令停止经营，并依据上述规定进行处罚。

四、交警与道路运输管理机构的协作

• 一般情况：交警部门不直接管理非法营运，但在执勤过程中可能会发现并处理一些涉嫌非法营运的车辆，如将车辆暂扣并移交至道路运输管理机构进行进一步处理。
• 特殊情况下的协同执法：在某些特殊情况下，如整治交通秩序的统一行动中，交警部门会配合道路运输管理机构开展联合执法行动，协助调查和处理非法营运车辆，提供必要的支持和保障。

五、实际案例与法律建议

• 实际案例：假设某驾驶员未取得营运资质，擅自从事客运经营，被交警在执勤过程中发现。交警可能会将车辆暂扣，并通知道路运输管理机构前来处理。道路运输管理机构将依据相关法律法规对驾驶员进行处罚。
• 法律建议：
  • 对于驾驶员而言，应严格遵守相关法律法规，取得合法的营运资质后再从事道路运输经营。
  • 对于乘客而言，应选择合法的运输工具，避免乘坐非法营运车辆，以保障自身安全。
  • 若发现非法营运行为，可向道路运输管理机构或交警部门举报。

综上所述，非法营运行为主要由县级以上道路运输管理机构负责管理和处罚，交警部门在特定情况下会予以协助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。