核心结论：离职后不配合公司办理股权转让，公司可依据法律规定和合同约定，通过协商、发送律师函、提起诉讼或仲裁等方式解决。以下从不同角度详细分析：

从协商角度

1. 友好沟通：公司可以先尝试与离职员工进行友好协商，了解其不配合的具体原因。例如，员工可能对股权转让价格存在异议，或者认为公司存在未履行完毕的义务等。通过沟通，双方可以明确分歧点，并寻求解决方案。
2. 提出合理方案：在协商过程中，公司可以根据实际情况提出合理的股权转让方案。比如，如果员工对价格有异议，公司可以提供市场评估报告，或者邀请第三方机构进行评估，以确定一个公平合理的价格。

从合同约定角度

1. 审查合同条款：公司应仔细审查与员工签订的股权相关合同，查看其中是否对离职后股权转让有明确约定。如果合同中有明确规定员工在离职后必须配合办理股权转让手续，以及不配合时应承担的责任，那么公司可以依据合同约定要求员工履行义务。
2. 发送律师函：若员工仍不配合，公司可以委托律师向员工发送律师函，明确指出其违反合同约定的行为，并要求其在规定期限内配合办理股权转让手续。律师函具有一定的法律威慑力，可能会促使员工履行义务。

从法律诉讼或仲裁角度

1. 提起诉讼：如果协商和发送律师函均无法解决问题，公司可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，公司需要提供相关证据，如股权合同、离职证明、协商记录等，以证明员工存在不配合办理股权转让的行为，并要求法院判决员工履行义务。
2. 申请仲裁：如果公司与员工在股权合同中约定了仲裁条款，那么公司可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序相对灵活，且具有一裁终局的特点，能够较快地解决纠纷。

从公司内部管理角度

1. 完善制度：为了避免类似情况再次发生，公司应完善内部股权管理制度，明确员工离职后股权转让的流程和责任。例如，规定员工在离职前必须签署股权转让协议，并配合办理相关手续，否则将承担一定的违约责任。
2. 加强培训：公司可以定期组织员工进行股权相关知识的培训，让员工了解股权转让的重要性和相关法律规定，提高员工的法律意识和配合度。

建议：公司在处理此类问题时，应根据具体情况选择合适的方式，并注意保留相关证据，以维护自身的合法权益。如果你还有其他关于股权转让或公司法律事务方面的问题，可以直接向我咨询。