在机动车与绿牌车（通常指新能源汽车）发生交通事故且双方负同等责任的情况下，赔偿问题主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关司法解释来处理。以下是详细的分析和解答：
赔偿原则：
- 在同等责任的情况下，双方各自承担自己因事故造成的损失的50%。这意味着，如果一方有车辆损坏或人员受伤，其总损失（包括医疗费、车辆维修费等）将由双方各承担一半。
具体赔偿流程：
- 报案与定损：事故发生后，双方应立即报警并通知各自的保险公司。保险公司会派员到现场勘查，并对车辆损失进行定损。
- 提交索赔材料：双方需向各自的保险公司提交索赔材料，包括事故认定书、医疗证明、车辆维修发票等。
- 赔偿计算：保险公司会根据定损结果和事故责任比例，计算各自应承担的赔偿金额。在同等责任的情况下，就是各自承担总损失的50%。
- 支付赔偿：保险公司会在审核通过后，向被保险人支付赔偿金额。如果双方都有保险，且保险额度足够，那么赔偿过程通常会比较顺利。
特殊情况处理：
- 如果一方未购买保险或保险额度不足：那么该方可能需要自行承担超出保险额度的部分损失。例如，如果一方的车辆维修费为1万元，但其保险额度只有5000元，那么该方需要自行承担剩余的5000元。同时，由于双方是同等责任，所以另一方也只需要承担其总损失（包括自己的车辆维修费和可能的人员受伤费用等）的50%，对于超出部分，不承担额外责任。
- 如果事故造成人员伤亡：除了车辆损失外，还需要考虑医疗费、误工费、护理费等赔偿项目。这些费用的计算和分担同样遵循同等责任的原则，即双方各承担50%。
法律建议：
- 保留好相关证据：如事故现场照片、视频、事故认定书、医疗证明、车辆维修发票等，以便在索赔时提供有力支持。
- 及时与保险公司沟通：在事故发生后，及时与保险公司联系并告知事故情况，以便保险公司能够及时派员勘查和定损。
- 考虑法律途径：如果双方在赔偿问题上无法达成一致，可以考虑通过法律途径解决纠纷。可以向我咨询具体的法律程序和策略。
举例说明：假设两车相撞，A车（机动车）和B车（绿牌车）各负同等责任。A车的维修费为8000元，B车的维修费为12000元。同时，A车上的乘客受伤，医疗费为5000元。那么，根据同等责任的原则：
- A车应承担自己维修费的50%，即4000元；同时承担B车维修费的50%，即6000元；以及自己乘客医疗费的50%，即2500元。但由于A车是责任方之一，所以实际上A车需要向B车支付6000元维修费，并承担自己乘客的2500元医疗费（这部分可能由A车的车上人员责任险覆盖）。同时，A车自己的4000元维修费中，有2000元（即B车应承担的部分）可以向B车或B车的保险公司索赔。
- 同理，B车也需要承担自己维修费的50%（即6000元中已由A车承担的部分不再重复计算），但实际上B车会收到A车支付的6000元维修费作为赔偿；同时，B车如果购买了相应的保险，其保险公司会支付B车剩余的维修费（如果有的话）以及可能的人员受伤费用（如果有的话）的50%。在这个例子中，由于我们只考虑了A车乘客的受伤费用，且未提及B车人员受伤，所以B车主要关注的是车辆维修费的赔偿。
总结来说，在同等责任的情况下，双方各自承担自己损失的50%，并通过保险公司进行赔偿。如果遇到特殊情况或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。