在司法鉴定与实际修车天数存在差异，且实际修车天数小于鉴定天数的情况下，通常应以实际修车天数为准，但具体还需结合案件实际情况和证据规则进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
证据效力角度：
- 司法鉴定意见书作为专业机构出具的专业意见，在诉讼中通常具有较高的证明力。然而，这并不意味着鉴定意见就是绝对不可推翻的。如果实际修车天数有充分的证据支持，如修车厂出具的修车记录、发票、维修合同等，且这些证据能够形成完整的证据链，证明实际修车天数确实少于鉴定天数，那么法院在审理案件时，会倾向于采纳实际修车天数作为认定事实的依据。
合同约定角度：
- 如果合同中明确约定了修车天数的计算方式或标准，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照合同约定执行。在这种情况下，即使司法鉴定意见书给出的修车天数与合同约定不符，也应以合同约定为准。当然，如果合同约定存在模糊或歧义，且双方无法达成一致意见，那么法院可能会结合其他证据和实际情况进行综合判断。
公平合理角度：
- 在处理此类纠纷时，法院还会考虑公平合理的原则。如果实际修车天数明显少于鉴定天数，且没有合理的解释或证据支持鉴定天数的合理性，那么法院可能会认为鉴定意见存在瑕疵或错误，从而采纳实际修车天数作为认定事实的依据。这有助于维护当事人的合法权益，确保案件处理的公正性和合理性。
法律建议：
- 如果您面临此类纠纷，建议首先收集并整理好所有与修车天数相关的证据，如修车记录、发票、维修合同等。这些证据将有助于您证明实际修车天数的情况。
- 同时，您也可以考虑委托专业机构对修车天数进行重新鉴定或评估，以获取更准确、更客观的证据。当然，这需要根据案件的具体情况和实际需要来决定。
- 在诉讼过程中，您应积极配合法院的审理工作，如实陈述事实、提供证据，并尊重法院的判决结果。如果对判决结果有异议，您可以在法定期限内提起上诉或申请再审等法律程序来维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果法院最终采纳实际修车天数作为认定事实的依据，那么这可能会对案件的赔偿金额、责任划分等方面产生影响。因此，在处理此类纠纷时，您应充分考虑各种可能的结果，并做好相应的准备和应对措施。