结论：合同的扫描件在特定条件下具有法律效力，但其法律效力通常低于原件。为确保合同的有效性和可执行性，建议尽量使用合同原件，并在必要时通过其他方式增强扫描件的证明力。
详细分析：
扫描件的法律效力基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同可以采用书面形式、口头形式或其他形式。书面形式不仅限于纸质合同书，还包括可以有形地表现所载内容的其他形式，如传真、电子邮件等能够有形地表现所载内容并可以随时调取查用的数据电文。因此，合同扫描件作为数据电文的一种，在符合特定条件时，可以被视为书面形式的合同，从而具备法律效力。
影响扫描件法律效力的因素：
- 双方认可与真实性无争议：如果合同双方在签订纸质合同的同时对合同进行了扫描并留存，且在后续交易过程中双方均认可扫描件的内容与纸质合同一致，那么扫描件可以作为证据使用，具有法律效力。若对方对扫描件的真实性无异议，或者在纠纷解决过程中通过其他证据（如往来邮件、聊天记录等）能够证明扫描件的真实性和完整性，扫描件同样可以被视为有效证据。
- 与其他证据形成证据链条：扫描件作为单独的证据时，其证明力相对较弱。但如果能与其他相关证据（如双方的聊天记录、邮件往来、履行合同的相关凭证等）相互印证，形成完整的证据链条，那么扫描件的证明力将得到显著增强，从而具有较高的法律效力。
- 合同约定与实际履行：如果合同双方在合同中明确约定了以扫描件作为合同的有效形式，并且在实际履行中按照此约定执行，那么扫描件自然具有法律效力。在实际履行过程中，如果对方通过书面、口头等方式明确承认扫描件的效力，或者以实际行动表明按照扫描件所约定的内容履行了相应义务，那么该扫描件也具有法律效力。
扫描件法律效力的局限性：
- 尽管在一定条件下扫描件具有法律效力，但由于其作为复印件或传来证据存在被篡改的风险，且难以直接证明其来源的可靠性，因此其法律效力通常低于原件。在发生合同纠纷时，如果对方对扫描件的真实性提出异议，而提供方又无法提供其他有力证据予以佐证，那么仅凭扫描件可能难以充分证明合同关系的存在及合同内容。
建议与实践指导：
- 尽量保留原件：在签订合同时，应尽可能保留合同原件以确保合同的最高法律效力。
- 增强扫描件证明力：如果只能获取或提供扫描件，应通过与对方确认（如发送邮件要求对方承认扫描件的真实性）、第三方见证、公证等方式增强其证明力。例如，可以要求对方在扫描件上签字或盖章确认，并保留双方沟通记录作为佐证。
- 收集相关证据：在履行合同过程中，注意收集和保存与合同相关的其他证据材料，如发货单、付款凭证等，以便在需要时形成完整的证据链条支持主张。
示例说明：
假设甲公司与乙公司签订了一份买卖合同，并同时保留了纸质合同和扫描件。在后续交易过程中，双方均按照合同约定履行了各自义务。若此时发生纠纷，甲公司提供了合同扫描件作为证据，且乙公司对扫描件的真实性无异议，同时甲公司还能提供发货单、付款凭证等其他证据与扫描件相互印证，那么该扫描件将具有较高的法律效力，可以作为认定案件事实的依据。
法律后果：
若仅凭扫描件且无法提供其他有力证据支持其主张，在合同纠纷中可能面临败诉的风险。因此，为确保合同的有效性和可执行性，建议尽量使用合同原件，并在必要时采取相应措施增强扫描件的证明力。
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