工程以包代管是否违法，需根据具体情况来判断，但通常来说，如果“以包代管”行为违反了相关法律法规对于工程分包、发包以及承包主体资质的规定，那么这种行为就是违法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规依据与违法情形
《中华人民共和国建筑法》的相关规定：
- 该法明确规定了建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但必须经建设单位认可，且主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。
- 如果“以包代管”行为涉及未经发包人同意分包、分包给无资质单位、主体结构分包或分包单位再分包等情形，那么这些行为都是违法的。
违法发包与承包的具体情形：
- 将工程发包给不具备相应资质的单位或个人，如个人承包建筑工程，这是违法的。
- 肢解发包，即将一个整体工程项目肢解成若干部分，分别发包给不同的承包单位，这种行为也是违法的，因为它破坏了工程的统一性和协调性。
- 设置不合理的招标投标条件，以限制、排斥潜在投标人或投标人，违背了公平竞争的原则，同样属于违法行为。
二、违法“以包代管”的法律后果
合同无效：
- 如果“以包代管”行为违反了法律法规的强制性规定，那么相关合同可能被认定为无效。这意味着合同中的条款对双方不具有法律约束力，双方可能无法依据合同主张权利或履行义务。
法律责任：
- 违法“以包代管”的行为可能面临行政处罚，如责令改正、罚款、暂停项目执行或资金拨付等。
- 如果因违法“以包代管”导致工程质量问题或安全事故，相关责任单位和个人还可能承担民事责任，甚至刑事责任。
实际施工人的权益保护：
- 尽管违法“以包代管”的合同可能无效，但实际施工人仍可以参照合同约定主张工程款。然而，这并不意味着违法“以包代管”的行为是合法的，而是基于公平原则和实际情况对实际施工人的一种保护。
三、合法工程管理的建议
严格遵守法律法规：
- 在进行工程分包、发包时，必须严格遵守《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规的规定，确保分包、发包行为的合法性和合规性。
选择具备资质的承包单位：
- 在选择承包单位时，应确保其具备相应的资质条件，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。避免将工程发包给不具备相应资质的单位或个人。
加强工程管理：
- 作为发包单位或总承包单位，应加强对工程的管理和监督，确保工程质量和施工安全。避免“以包代管”等违法行为的发生。
总结来说，工程以包代管是否违法取决于具体行为是否违反了相关法律法规的规定。为了避免法律风险和保障工程质量和施工安全，建议相关单位和个人严格遵守法律法规，选择具备资质的承包单位，并加强工程管理。如果您在工程管理中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。