结论：旷工三天自动离职是否有补偿，需根据具体情况判断，主要取决于是否给用人单位造成了经济损失、劳动合同或公司规章制度中的相关约定，以及用人单位是否存在违法行为。以下从不同角度为你详细分析：

员工可能需向用人单位赔偿的情况

1. 经济损失赔偿
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条规定，劳动者违反本法规定解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
   • 常见情形：比如员工未做好交接导致商业秘密泄露，给公司带来商业损失；关键岗位员工突然离职导致业务停滞，造成岗位空缺损失；员工违反服务期约定离职且需支付培训费用的违约金等。如果旷工三天自动离职的行为符合这些情形，员工可能需要向用人单位赔偿相应损失。
2. 违约金或其他费用
   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定旷工需支付违约金或其他相关费用，并且这些规定是合法有效的，员工需按约定赔偿。例如，公司规定旷工一天扣除一定金额的违约金，旷工三天就需按此规定支付相应违约金。

用人单位可能需向员工支付补偿的情况

• 单位存在违法行为
  • 如果用人单位存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，员工旷工三天自动离职可视为因用人单位过错而离职。
  • 经济补偿标准：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。例如，员工在公司工作了3年，月工资为5000元，那么用人单位需支付的经济补偿为\(5000×3 = 15000\)元。

特殊情况分析

1. 规章制度不合法或未公示
   • 若用人单位的规章制度关于旷工辞退的规定未经民主程序制定，或虽制定但未向员工公示，则该规章制度对员工不具有约束力。此时，用人单位以三天旷工为由辞退员工可能构成违法解除劳动合同，需按照《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条的规定，支付经济补偿标准的二倍作为赔偿金。例如，员工在公司工作了2年，月工资为6000元，正常经济补偿为\(6000×2 = 12000\)元，那么违法解除劳动合同的赔偿金就是\(12000×2 = 24000\)元。
2. 特殊客观原因导致旷工
   • 如员工因突发重大疾病、遭遇不可抗力等特殊原因旷工，并能提供合理证明材料，这种旷工可能不构成严重违反劳动纪律。在此情况下，用人单位辞退员工可能被认定为不合理，需按劳动者在本单位工作的年限支付经济补偿。

建议

1. 对于员工：尽量避免旷工等违纪行为，以免影响自己的职业声誉和未来的就业机会。如果因特殊原因旷工，要及时与用人单位沟通，并提供相关证明材料。
2. 对于用人单位：应完善规章制度，明确旷工等违纪行为的处理方式和赔偿责任，确保规章制度经过民主程序制定并公示。在处理旷工问题时，要注重证据的收集与保存，如考勤记录、员工请假条等。同时，要充分考虑是否有特殊客观原因导致员工旷工，避免不必要的法律纠纷。

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