在司机因肇事罪取得谅解书后，保险公司的赔偿款原则上仍应支付给受害方或其法定继承人，具体分配需根据事故责任、保险合同条款及实际损失情况综合判定。以下是详细分析：

1. 赔偿款的支付对象
   根据《民法典》第1213条，交通事故造成损害的，先由交强险在责任限额内赔偿，不足部分由商业险补充，仍有不足的由侵权人（司机）赔偿。谅解书的存在不影响保险公司的法定赔偿义务，赔偿款仍应支付给受害方或其法定继承人（如受害方已死亡）。若受害方为多人，则按各自损失比例分配。

2. 谅解书对赔偿款的影响
   谅解书是受害方对司机刑事责任的谅解文件，通常涉及刑事案件中的量刑协商（如从轻、减轻处罚），但不改变民事赔偿的法律关系。保险公司不会因谅解书而直接将赔偿款支付给司机，除非存在以下特殊情形：

   • 司机已先行垫付全部赔偿款，且受害方同意将保险理赔权转让给司机（需书面协议）；
     
   • 保险合同中明确约定“谅解书可作为赔偿款支付给被保险人的条件”（此类条款极少见且可能因违反公序良俗被认定无效）。

3. 实务中的常见操作

   • 受害方直接索赔：受害方或其家属可凭事故认定书、医疗记录、谅解书等材料，直接向保险公司主张赔偿。保险公司审核后，将赔偿款支付至受害方账户。
     
   • 司机代为申请：若司机已与受害方达成赔偿协议并取得授权，可代为办理理赔，但赔偿款仍需支付给受害方（司机可能通过协议约定从受害方处获得返还，但这属于民事合同关系，与保险公司无关）。
     
   • 法院调解/判决：若双方对赔偿有争议，法院可能根据谅解书情节（如司机积极赔偿获谅解）在民事赔偿中适当调整责任比例，但保险公司仍需按最终判决金额支付。

4. 风险提示

   • 若司机通过欺骗、胁迫等方式取得谅解书，或赔偿款未实际支付给受害方，保险公司可能拒绝理赔或追偿。
     
   • 受害方应保留好医疗发票、谅解书等证据，避免赔偿款被司机截留。

建议：若您是受害方，务必在签署谅解书前明确赔偿款的支付方式及金额，并要求司机或保险公司出具书面承诺；若您是司机，切勿误以为谅解书可“转移”赔偿义务，仍需配合受害方完成理赔流程。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。