公司股权质押后又被司法冻结，执行时需分情况处理，具体如下：

1. 质押权与冻结措施的效力冲突
   根据《民法典》第445条及《公司法》相关规定，股权质押自登记时设立，质权人依法享有优先受偿权。但若股权被司法冻结，根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》第53条，冻结措施会限制股权的转让、质押等处分行为。此时需明确：

   • 冻结时间早于质押登记：若冻结在先，质押可能因违反《民法典》第446条“不得对抗善意第三人”或《公司法》第141条（上市公司股权转让限制）而无效，质权人无法主张优先受偿权。
     
   • 质押登记早于冻结：质权人仍享有优先受偿权，但冻结措施会限制质权实现程序（如拍卖、变卖），需通过法院协调执行顺序。

2. 执行程序中的优先权实现

   • 质权人主动申请参与分配：根据《民事诉讼法解释》第508条，质权人可凭质押登记证明向执行法院申报债权，主张优先受偿。法院需在财产分配方案中明确质权人的优先地位。
     
   • 冻结债权人提出异议：若冻结债权人认为质押损害其权益（如质押系恶意串通设立），可依据《民事诉讼法》第232条提出执行异议，法院将审查质押合法性。
     
   • 协调执行顺序：若质押合法有效，法院通常应先满足质权人优先受偿后，剩余价值再分配给冻结债权人；若质押无效，则按冻结债权比例分配。

3. 实务操作建议

   • 质权人：立即向执行法院提交质押登记证明、借款合同等材料，申请参与分配并主张优先权；同时可申请解除部分冻结措施（如冻结价值远超债权时）。
     
   • 冻结债权人：核查质押登记时间及合同效力，若发现质押系事后补办或存在其他瑕疵，可申请法院认定质押无效并撤销优先权。
     
   • 公司及其他股东：若冻结或质押影响公司经营，可依据《公司法》第182条申请公司解散（极端情况），或通过股东会决议限制相关股权表决权。

风险提示：若股权价值不足以覆盖质押债权与冻结债权，质权人可能面临部分债权无法实现的风险；若质押合同存在无效情形（如主合同无效、未办理登记），质权人将丧失优先权。建议各方委托律师介入，通过执行异议之诉或参与分配程序明确权利顺序。