非营运车超员50%以上是一种严重的交通违法行为，将依据《道路交通安全法》及相关法规受到严厉处罚。具体处罚措施根据车辆类型、超员程度及行驶情况有所不同，以下是详细分析：

一、一般情况（私家车等非营运小型客车）

对于非营运的小型客车（如私家车），若载人超过核定人数50%以上但未达到100%，依据《道路交通安全法》第九十条和《道路交通安全违法行为记分管理办法》，处罚如下：

1. 罚款：处二十元以上二百元以下罚款。
2. 记分：一次记9分。

举例说明：如果一辆核载5人的私家车，实际载客8人（超员60%），那么驾驶员将面临二十元以上二百元以下的罚款，并且驾驶证一次记9分。

二、特殊情况（校车、公路客运汽车、旅游客运汽车等，虽为非营运但按特殊规定处理）

对于校车、公路客运汽车、旅游客运汽车等非营运载客车，若载人超过核定人数50%以上，处罚更为严格：

1. 罚款：根据《道路交通安全法》第九十二条，处五百元以上二千元以下罚款。
2. 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，一次记12分。

特别指出：若驾驶这些车辆载人超过核定人数20%以上，即会面临一次记12分的处罚。这意味着，对于这类车辆，超员20%以上就已经达到了最严厉的记分标准。

三、其他相关规定与注意事项

1. 7座以上载客汽车：若载人超过核定人数50%以上但未达到100%，同样一次记9分，并可能面临二十元以上二百元以下的罚款。
2. 运输单位责任：如果运输单位的车辆存在超员情况，且经处罚不改，对直接负责的主管人员将处二千元以上五千元以下罚款。
3. 刑事责任：若超载行为导致交通事故，并构成犯罪，将依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
4. 地方实施细则：各地在具体执行过程中，可能会根据本地实际情况制定一些实施细则，处罚标准可能会略有差异，但总体在法律规定的框架范围内。

四、总结与建议

非营运车超员严重危及道路交通安全，不仅可能引发交通事故，还将受到法律的严厉制裁。因此，我强烈建议驾驶员务必遵守交通规则，严禁超载行驶，确保自己和他人的生命安全。同时，运输单位也应加强车辆管理，防止超员情况的发生，确保乘客的生命财产安全。

如果您有任何关于交通运输领域的法律问题或疑虑，请直接向我咨询，我会为您提供专业、全面的法律解答。