结论：法院一般不会直接下通知强行执行不动产登记，但可能通过其他方式推动合同履行或解决纠纷，具体需结合案件情况判断。

1. 小产权房合同效力与登记限制

小产权房通常指在农村集体土地上建设、未取得合法产权证书的房屋。根据《民法典》及相关土地管理法规，非本村集体经济组织成员（即“非本村人”）购买小产权房的合同，可能因违反法律强制性规定（如土地管理法第62条关于宅基地使用权流转的限制）而被认定无效或部分无效。即使买方胜诉，法院判决的履行内容也受限于不动产登记的法定条件。

不动产登记机构对小产权房的登记有严格限制：若房屋未取得合法建设审批手续或土地性质不符合登记要求（如宅基地使用权未依法流转），登记机构会拒绝办理登记。此时，法院无法通过强制执行程序突破登记机构的法定职责。

2. 法院强制执行的边界

法院强制执行需以生效法律文书为依据，且执行内容必须合法、可行。若判决内容为“要求卖方协助办理不动产登记”，但登记机构因房屋性质拒绝登记，法院通常不会直接强制登记机构办理，而是可能采取以下措施：

• 折价赔偿：若合同无效或无法履行，法院可能判决卖方返还购房款并赔偿买方损失（如房屋增值部分、装修费用等）；
• 返还房屋：若买方已实际占有房屋，法院可能判决维持现状，但明确双方权利义务（如买方无产权，仅享有使用权）；
• 协调解决：在极少数情况下，若房屋符合补办手续条件（如历史遗留问题），法院可能协调相关部门推动登记，但需以政策允许为前提。

3. 买方胜诉后的实际风险

即使买方在合同纠纷中胜诉，仍需面对以下风险：

• 产权无法落实：小产权房的“胜诉”可能仅限于金钱赔偿，无法实现产权过户；
• 房屋被拆除：若房屋属于违法建设，可能面临行政强制拆除，买方损失进一步扩大；
• 政策变化风险：部分地区对小产权房的处置政策可能调整，但通常以“禁止交易、逐步消化”为主，买方权益难以通过司法程序完全保障。

4. 建议与注意事项

• 谨慎购买小产权房：非本村人购买小产权房存在重大法律风险，建议优先选择合法商品房；
• 合同条款设计：若已购买，可在合同中约定违约责任（如高额违约金）或担保条款，增加卖方违约成本；
• 及时咨询律师：若涉及纠纷，需结合房屋建设手续、土地性质、当地政策等综合判断，建议携带合同、付款凭证等材料具体咨询。

如有进一步疑问，可直接向我提问，我会结合具体案情为您详细分析。