物业对楼上种菜纠纷是否负有责任，需视具体情况而定，但通常情况下，物业是有一定责任的。以下从不同角度进行分析：

一、物业的基本管理责任

物业作为小区的管理者，其基本职责包括维护小区的公共秩序、环境卫生以及公共设施设备的正常运行。楼上种菜行为，如果涉及占用公共区域（如楼顶、平台等），或者种菜过程中产生了垃圾、异味、蚊虫等影响小区环境卫生和公共秩序的问题，那么物业就有责任进行管理和制止。

二、物业对违规行为的制止义务

根据《物业管理条例》等相关法律法规，物业有权对小区内的违规行为进行制止，并及时向有关行政管理部门报告。如果楼上种菜行为违反了小区的管理规约或者相关法律法规，物业应当及时采取措施，如劝阻、制止，并向相关部门报告，以维护小区的正常秩序和业主的合法权益。

三、物业未履行责任的后果

如果物业在发现楼上种菜行为后，未及时采取措施进行制止和管理，导致问题持续存在或者扩大，那么物业可能需要承担一定的法律责任。例如，如果因楼上种菜导致楼下业主的财产受损（如漏水、渗水等），而物业未尽到管理职责，那么物业可能需要与种菜业主共同承担赔偿责任。

四、具体案例分析

1. 如果种菜行为在业主专有部分内：即业主在自己家的阳台、窗户等专有部分内种菜，且未对公共区域或他人造成影响，那么物业通常无需直接介入。但物业可以提供建议或指导，帮助业主合理种菜，避免对他人造成不便。
2. 如果种菜行为在公共区域或影响他人：如占用楼顶、平台等公共区域种菜，或者种菜过程中产生了垃圾、异味等影响他人生活的问题，那么物业就有责任进行管理和制止。物业可以首先与种菜业主进行沟通协商，要求其停止违规行为；如果协商无果，物业可以向相关部门报告，并配合相关部门进行处理。

五、建议与措施

1. 加强沟通协商：物业应首先与种菜业主进行沟通协商，明确告知其种菜行为可能带来的问题和后果，要求其停止违规行为。
2. 完善管理规约：物业可以制定或完善小区的管理规约，明确禁止在公共区域种菜等违规行为，并规定相应的处罚措施。
3. 加强巡查监督：物业应加强对小区的巡查监督力度，及时发现并制止违规行为。
4. 寻求法律支持：如果物业无法自行解决问题，可以寻求法律支持，如向相关部门报告或提起诉讼等。

总结来说，物业对楼上种菜纠纷是否负有责任，需根据具体情况来判断。但无论如何，物业都应积极履行其管理职责，维护小区的公共秩序和环境卫生。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。