变造国家公文的追诉时效是从犯罪之日起计算，而非发现之时。以下是详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国刑法》第八十七条的规定，犯罪经过下列期限不再追诉：

1. 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；
2. 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；
3. 法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；
4. 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。

同时，根据《中华人民共和国刑法》第八十八条和第八十九条的规定，追诉期限的计算有以下要点：

• 从犯罪之日起计算：犯罪行为有连续或者继续状态的，从犯罪行为终了之日起计算。在追诉期限以内又犯罪的，前罪追诉的期限从犯后罪之日起计算。
• 不受追诉期限限制的情形：在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的限制。被害人在追诉期限内提出控告，人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的，不受追诉期限的限制。

具体到变造国家公文的情况

变造国家公文属于犯罪行为，其追诉时效的计算应遵循上述法律规定。具体来说：

• 犯罪之日：即行为人实施变造国家公文行为的那一天。
• 追诉时效期限：根据变造国家公文行为的严重程度和可能判处的刑罚，确定相应的追诉时效期限。例如，如果变造国家公文行为可能判处三年以下有期徒刑，那么追诉时效期限就是五年。

追诉时效的计算方式

追诉时效的计算是从犯罪之日起算，而不是从发现犯罪之日起算。这意味着，即使犯罪行为在多年后才被发现，只要从犯罪之日起算未超过追诉时效期限，就可以对犯罪行为人进行追诉。

特殊情况

如果变造国家公文的行为人在追诉期限内又实施了其他犯罪行为，那么前罪的追诉期限将从犯后罪之日起重新计算。此外，如果行为人在追诉期限内逃避侦查或审判，或者被害人提出控告而司法机关未予立案，那么追诉时效将不受限制。

总结与建议：

变造国家公文的追诉时效是从犯罪之日起计算。在处理此类案件时，应准确确定犯罪之日，并根据可能判处的刑罚确定追诉时效期限。如果行为人在追诉期限内又实施了其他犯罪行为或逃避侦查、审判，或者被害人提出控告而司法机关未予立案，那么追诉时效的计算将受到影响。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。