结论：偷盗犯涉案金额五万被法院判刑后，仍然可以协商赔偿100万，但这一协商过程及其结果需遵循一定的法律原则和程序。

分析说明：

1. 刑事判决与民事赔偿的独立性：

   • 刑事判决主要关注的是犯罪行为的性质、情节以及犯罪人的刑事责任，它并不直接涉及民事赔偿问题。因此，即使犯罪人已经被法院判刑，这并不妨碍其与被害人就民事赔偿进行协商。
   • 在本案例中，偷盗犯涉案金额五万，法院已经根据这一事实对其作出了刑事判决。但这并不影响犯罪人与被害人就超出涉案金额的赔偿进行协商，如协商赔偿100万。

2. 协商赔偿的合法性与合理性：

   • 协商赔偿是双方自愿的行为，只要不违反法律法规的强制性规定，就是合法的。在本案例中，犯罪人与被害人可以就赔偿金额、赔偿方式等事项进行协商，并达成一致意见。
   • 然而，协商赔偿的金额应当合理，不能过分高于或低于实际损失。如果赔偿金额过高，可能被视为不合理的赔偿，甚至可能引发新的法律纠纷。因此，在协商过程中，双方应当充分考虑实际损失、犯罪人的经济状况等因素，确保赔偿金额的合理性。

3. 协商赔偿对刑事判决的影响：

   • 协商赔偿本身并不会改变已经作出的刑事判决。但是，如果犯罪人积极赔偿被害人的损失，并取得被害人的谅解，这可能会在量刑时作为从轻或减轻处罚的情节予以考虑。
   • 在本案例中，如果犯罪人与被害人协商赔偿100万，并成功取得被害人的谅解，那么这一情节可能会在未来的量刑调整或减刑申请中起到积极作用。

4. 协商赔偿的程序与注意事项：

   • 协商赔偿应当遵循自愿、公平、诚实信用的原则。双方应当充分沟通、协商，并达成书面协议，以明确各自的权利和义务。
   • 在协商过程中，犯罪人应当如实告知自己的经济状况和赔偿能力，避免虚假承诺或恶意欺诈。同时，被害人也应当理性对待赔偿问题，不要过分追求高额赔偿而忽视实际损失和犯罪人的经济状况。
   • 如果双方无法就赔偿问题达成一致意见，或者协商过程中出现争议和纠纷，可以寻求法律途径解决，如通过诉讼或仲裁等方式来维护自己的合法权益。

行动建议：

• 如果你是犯罪人或其家属，希望与被害人协商赔偿事宜，建议首先与被害人进行充分沟通，了解其诉求和期望。同时，也要考虑自己的经济状况和赔偿能力，确保赔偿金额的合理性。
• 如果你是被害人或其家属，希望获得合理的赔偿，建议与犯罪人或其家属进行协商，并寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。在协商过程中，要保持理性、客观的态度，不要过分追求高额赔偿而忽视实际损失和犯罪人的经济状况。
• 无论你是犯罪人还是被害人，在协商赔偿过程中都要遵循法律法规的规定和程序要求，确保协商结果的合法性和有效性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。