针对公职人员因违纪立案且不正确履行职责，导致16万元租赁款通过法院程序仍未收回的情况，处理方式需结合违纪性质、损失后果及责任认定综合判断，具体如下：

1. 违纪行为的定性及处分依据

• 违纪性质：若公职人员存在故意或重大过失（如未及时采取诉讼保全、未积极配合执行等），导致国有资产或单位财产损失，可能构成《中华人民共和国公职人员政务处分法》第三十九条规定的“不履行或不正确履行职责，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失”的情形。
• 处分类型：根据损失程度和情节轻重，可给予警告、记过、记大过、降级、撤职或开除等政务处分。若涉及贪污、受贿等违法犯罪行为，需移送司法机关追究刑事责任。

2. 损失后果的认定与责任划分

• 直接责任：若公职人员是租赁款回收的直接负责人，且因故意或重大过失导致款项未收回，需承担主要责任。例如，未在诉讼时效内起诉、未提供关键证据导致败诉、未申请强制执行等。
• 领导责任：若单位领导存在监管失职（如未督促履行职责、未审批必要措施），可能需承担相应领导责任，处分力度通常轻于直接责任人。

3. 处理程序与证据要求

• 调查程序：由单位或纪检监察机关立案调查，收集证据（如工作记录、法院文书、证人证言等），查明未收回款项的具体原因及责任人。
• 听证与申辩：涉事公职人员有权申辩，单位需依法保障其陈述、申辩权利，避免处分程序违法。
• 处分决定：根据调查结果，单位作出政务处分决定，并书面通知本人；若涉嫌犯罪，移送检察机关审查起诉。

4. 损失追偿与救济途径

• 内部追偿：单位可依据《财政违法行为处罚处分条例》或内部财务制度，要求责任人赔偿部分或全部损失（如通过扣发奖金、工资等方式）。
• 司法追偿：若公职人员存在贪污、挪用等行为，单位可提起民事诉讼或刑事附带民事诉讼，要求其返还财产或赔偿损失。

5. 特殊情形处理

• 不可抗力或客观障碍：若因法院执行不力、债务人无财产等客观原因导致款项未收回，且公职人员已尽到合理职责，可能不构成违纪，但需提供充分证据证明。
• 历史遗留问题：若租赁款纠纷涉及历史政策或复杂法律关系，需结合具体背景分析责任，避免“一刀切”处理。

建议：单位应尽快启动调查程序，明确责任分工，同时咨询专业律师评估证据充分性及法律风险。涉事公职人员若对处分有异议，可依法申请复核或申诉。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。