有公章的借条6年后仍然可以起诉，且借条本身在符合法定条件下是有效的。以下从多个角度为你详细分析：

借条的有效性

1. 公章的作用：借条上加盖了公章，通常意味着该借条是单位或组织作为借款人出具的，或者至少得到了单位或组织的认可。公章作为单位或组织的正式印鉴，具有法律效力，能够证明借条的真实性和合法性。
2. 借条的法定要件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借条作为借款合同的一种形式，应当具备借款人和出借人的姓名或名称、借款金额、借款期限、利息等基本条款。只要借条内容完整、明确，且双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，借条就是有效的。
3. 6年的时间因素：借条的有效期并不受时间限制，只要借条内容合法、真实，且未超过法律规定的诉讼时效期间，借条就是有效的。6年的时间并不会使借条本身失效。

诉讼时效的问题

1. 一般诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，如果借条上约定的还款期限已经届满，且出借人在三年内未向借款人主张权利，那么借款人可能会提出诉讼时效抗辩，导致出借人丧失胜诉权。
2. 诉讼时效的中断与延长：然而，诉讼时效并非一成不变。如果出借人在诉讼时效期间内向借款人主张了权利（如通过发送催款通知、提起诉讼等方式），或者借款人同意履行还款义务，那么诉讼时效会中断并重新计算。此外，在特殊情况下，人民法院也可以根据出借人的申请决定延长诉讼时效期间。
3. 6年后的起诉：即使借条已经出具了6年，只要出借人能够证明在诉讼时效期间内曾经向借款人主张过权利，或者存在其他诉讼时效中断、延长的情形，那么出借人仍然有权向法院提起诉讼，要求借款人履行还款义务。

实际操作建议

1. 收集证据：在起诉前，出借人应当收集好借条原件、转账记录、催款通知等相关证据，以证明借款事实的存在和诉讼时效的中断或延长。
2. 咨询律师：由于诉讼时效问题涉及复杂的法律判断和证据收集，建议出借人在起诉前咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
3. 及时起诉：如果出借人决定起诉，应当尽快向法院提起诉讼，以免因诉讼时效问题而丧失胜诉权。

总结来说，有公章的借条6年后仍然可以起诉，且借条本身在符合法定条件下是有效的。但出借人需要注意诉讼时效问题，及时收集证据并咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。