当您发现法院在立案过程中存在适用法律错误，即案由错误的情况时，您可以根据案件所处的不同阶段，采取相应的措施来确保案件的公正、合法处理。以下是一些详细且具有深度的建议：
一、一审审理过程中
主动沟通：
- 您应尽快以书面或口头形式向承办法官反映案由错误的情况。在沟通时，提供相关证据或法律依据来支持您认为的正确案由，这样有助于法官更准确地理解案件的法律关系。
申请变更：
- 如果沟通效果不佳，您可以向法院提交《变更案由申请书》。在这份申请书中，详细阐述原案由错误的原因，以及您请求变更的正确案由。法院将审查您的申请，并决定是否进行变更。
二、一审判决后
- 上诉：
- 如果您对一审判决结果不满意，且认为案由错误是影响判决的重要因素之一，您可以在法定上诉期限内，向上一级法院提起上诉。在上诉理由中，详细说明案由错误及其对判决结果的影响。上一级法院将审查您的上诉理由，并可能撤销原判、发回重审或直接改判。
三、案件生效后的再审
- 申请再审：
- 如果案件已经生效，但您仍然认为案由错误对案件结果产生了实质性影响，且符合再审条件，您可以向作出生效裁判的上一级法院或原审法院申请再审。在申请再审时，提供充分证据证明案由错误及其实质性影响。法院经审查后，可能启动再审程序，纠正案由错误并重新作出裁判。
四、开庭过程中的权利
- 原告权利：
- 在开庭过程中，作为原告，您有权根据法律关系主张正确的案由。如果法院审判庭认为立案案由不恰当，他们将在必要时进行变更，以确保案件的公正审理。
五、法院自身发现案由错误的处理方式
一审过程中：
- 如果法院在审理过程中自行发现立案案由错误，他们会主动调整案由，重新审查案件事实和法律关系，并及时告知当事人，确保诉讼准备的充分性。
二审过程中：
- 如果二审法院在审理上诉案件时发现一审案由错误，他们将根据错误是否影响案件事实认定和法律适用进行处理。可能维持原判同时纠正案由，或撤销原判发回重审、直接改判并确定正确案由。
审判监督程序中：
- 如果通过审判监督程序发现立案案由错误，法院将对案件进行全面审查。对于因案由错误导致的判决错误，法院将依法纠正案由并重新作出公正裁判。
六、法律依据
- 主要法律：处理案由错误问题的主要法律依据是《中华人民共和国民事诉讼法》。
- 相关法条：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，判决书应当明确写明案由。若法院在审理过程中发现案由错误，应当在判决书中作出相应的更正。
综上所述，无论是当事人还是法院自身发现立案案由错误，均有明确的处理方式和法律依据。作为当事人，您应积极行使自己的权利，与法院沟通并配合更正；同时，法院也应依法履行职责，确保案件的公正、合法处理。希望这些建议能对您有所帮助。