分公司注销后，劳动关系相关纠纷仍然可以起诉，但具体起诉对象和方式需根据实际情况确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、分公司注销后的法律地位
分公司作为公司的分支机构，虽然不具有独立的法人资格，但其民事责任由公司承担。当分公司注销后，其民事主体资格消灭，不再具备承担民事责任的能力。然而，这并不意味着与分公司相关的劳动关系纠纷就无法通过法律途径解决。
二、起诉对象的选择
起诉公司：
- 由于分公司的民事责任由公司承担，因此，在分公司注销后，劳动者可以将其所属的公司作为被告，就劳动关系相关纠纷提起诉讼。
- 例如，若劳动者与分公司签订了劳动合同，但分公司注销后未支付工资或经济补偿，劳动者可以起诉公司要求支付。
起诉分公司负责人（特定情况下）：
- 在某些特殊情况下，如分公司负责人以分公司名义与劳动者签订劳动合同，但分公司注销后，公司拒绝承担责任，且分公司负责人存在过错或故意隐瞒分公司注销事实等情形，劳动者也可以考虑将分公司负责人作为共同被告或第三人，要求其承担相应的法律责任。但这种情况较为复杂，需要具体分析。
三、起诉的法律依据和程序
法律依据：
- 主要依据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《中华人民共和国公司法》等相关法律法规。
- 这些法律法规规定了劳动者的权益保护、劳动合同的签订和履行、公司注销后的责任承担等事项。
起诉程序：
- 劳动者应首先收集相关证据，如劳动合同、工资单、工作证等，以证明其与分公司存在劳动关系以及分公司注销后未支付相关费用的事实。
- 然后，劳动者可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，提交起诉状和相关证据材料。
- 法院将依法审理案件，并根据事实和法律规定作出判决。
四、注意事项
及时起诉：
- 劳动者应在知道或应当知道其权益受到侵害之日起一定期限内（通常为一年或两年，具体根据法律规定和案件情况确定）提起诉讼，以免超过诉讼时效而丧失胜诉权。
咨询专业律师：
- 由于劳动关系纠纷涉及的法律问题较为复杂，且每个案件的具体情况都不尽相同，因此劳动者在起诉前最好咨询专业律师的意见，以确保其权益得到充分保护。不过在这里您已经直接向我咨询了，我会为您提供专业的法律建议。
保留证据：
- 劳动者在劳动关系存续期间以及分公司注销后，都应妥善保留与劳动关系相关的证据材料，以便在需要时提供证明。
总结来说，分公司注销后，劳动关系相关纠纷仍然可以起诉。劳动者可以根据实际情况选择起诉公司或分公司负责人（特定情况下），并依据相关法律法规和程序进行起诉。在起诉过程中，劳动者应注意及时起诉、咨询专业律师并保留好相关证据。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。