店铺遇到恶意捣乱，是可以起诉的。以下从几个角度为你详细分析：

一、法律基础与起诉依据

根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定，任何组织或者个人不得以侮辱、诽谤等方式侵害他人的名誉权，也不得非法侵扰他人的经营秩序。如果店铺遇到的恶意捣乱行为，如故意破坏店铺设施、恶意诋毁店铺声誉、干扰店铺正常经营等，都可能构成对店铺合法权益的侵害，店铺有权依法提起诉讼，要求侵权人承担相应的法律责任。

二、起诉的具体情形与证据收集

1. 恶意破坏店铺设施：

   • 如果捣乱者故意破坏店铺的门窗、货架、商品等设施，造成店铺经济损失，店铺可以收集现场照片、视频监控、报警记录等证据，证明捣乱者的侵权行为，并据此提起诉讼。

2. 恶意诋毁店铺声誉：

   • 如果捣乱者通过散布谣言、恶意评价等方式诋毁店铺声誉，导致店铺客流量减少、销售额下降等经济损失，店铺可以收集相关网络言论、客户反馈、销售数据等证据，证明捣乱者的侵权行为及其造成的后果，并提起诉讼。

3. 干扰店铺正常经营：

   • 如果捣乱者通过聚众闹事、堵塞店门等方式干扰店铺正常经营，导致店铺无法正常营业或营业受到严重影响，店铺可以收集现场照片、视频监控、报警记录、经营数据等证据，证明捣乱者的侵权行为及其对店铺经营造成的损害，并提起诉讼。

三、起诉的流程与注意事项

1. 起诉流程：

   • 店铺在收集到充分证据后，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，提交起诉状及相关证据材料。
   • 法院在受理案件后，会依法进行审理，并根据事实和法律规定作出判决。

2. 注意事项：

   • 店铺在起诉前应确保收集到的证据充分、合法、有效，以支持其诉讼请求。
   • 店铺在起诉过程中应遵守法律程序，如实陈述事实，提供真实证据，不得伪造或篡改证据。
   • 店铺在起诉后应积极配合法院的审理工作，按时出庭应诉，履行法院作出的判决或裁定。

四、可能的法律后果与赔偿

如果法院认定捣乱者的行为构成侵权，捣乱者可能需要承担以下法律后果：

1. 停止侵害：捣乱者应立即停止对店铺的侵权行为，不得再实施类似行为。

2. 赔偿损失：捣乱者应赔偿店铺因其侵权行为所造成的经济损失，包括直接损失和间接损失。直接损失如店铺设施损坏的修复费用、商品损失等；间接损失如因店铺声誉受损导致的客流量减少、销售额下降等。

3. 赔礼道歉：如果捣乱者的行为对店铺的名誉权造成了侵害，捣乱者还应公开赔礼道歉，以消除影响、恢复名誉。

店铺在遇到恶意捣乱时，应积极收集证据，依法提起诉讼，维护自身合法权益。如果你在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。