关于摩托车跑海底隧道的处罚问题，这确实是一个涉及交通法规和地方性管理规定的重要议题。首先，需要明确的是，摩托车进入隧道的处罚规定会因地区及具体情况而有所不同，但主要依据的是《中华人民共和国道路交通安全法》及相关地方性交通管理规定。

一、法律依据与普遍原则

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人如果违反道路交通安全法律、法规关于道路通行的规定，将会面临警告或者二十元以上二百元以下的罚款。对于摩托车而言，如果地方有明确规定禁止其进入特定类型的隧道（比如城市快速路隧道或海底隧道），那么违规进入将会受到相应的处罚。

二、具体处罚措施

1. 扣分：

   • 在我国，摩托车违反相关规定进入隧道，通常会被扣除3分。这是除罚款外的一种常见处罚方式，旨在通过扣分制度来提醒和督促驾驶人遵守交通规则。

2. 罚款：

   • 罚款的金额通常在20元至200元之间，具体数额取决于违规的严重程度和地方性规定。如果摩托车在隧道内造成了交通妨碍或安全隐患，罚款的金额可能会更重。

3. 车辆暂扣或拖移：

   • 在极端情况下，如果摩托车在隧道内造成了严重的交通障碍或安全隐患，交通管理部门有权对车辆进行暂扣或拖移至不妨碍交通的地点。这是为了确保隧道内的交通秩序和安全。

三、特殊情况与申诉

• 无明确禁止标志：

  • 如果隧道入口没有明确禁止摩托车通行的标志，而摩托车驾驶人是在不知情的情况下进入隧道，那么在面对处罚时，可以向交通管理部门提出申诉。管理部门会根据实际情况考虑减轻或免除处罚。

• 及时改正与申诉：

  • 即使不小心违反了相关规定，摩托车驾驶人也应积极配合执法部门的工作，及时接受处罚并改正错误行为。同时，保留好相关证据（如隧道入口照片、行车记录仪记录等），以便在必要时提出申诉。

四、建议与总结

对于摩托车驾驶者来说，在进出隧道时，应严格遵守交通规则，确保自身和他人的行车安全。建议驾驶者在行驶过程中密切注意交通标志和路况信息，特别是关于隧道通行的规定。同时，了解并掌握相关法律法规及地方性交通管理规定，是保障自己合法权益的重要途径。

总的来说，摩托车跑海底隧道的处罚取决于多种因素，包括地区规定、违规严重程度以及是否有明确禁止标志等。因此，驾驶者在行驶前最好先了解清楚当地的相关规定，以避免不必要的麻烦和损失。