结论：公司克扣员工工资时，员工确实有权申请被动离职（即被迫解除劳动合同），并可以要求公司支付经济补偿。
法律依据与解析
解除劳动合同的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条第二款的规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同。这意味着，在公司克扣工资的情况下，员工有权依据此条款提出被迫离职。
经济补偿的规定：
- 依据《劳动合同法》第四十六条第一款，因用人单位存在克扣工资等情形导致劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
操作指南与注意事项
留存证据：
- 在提出被迫离职前，员工应妥善保留能够证明公司克扣工资的证据，包括但不限于工资条、银行工资流水明细、与公司关于工资问题的沟通记录（如邮件、短信、微信聊天记录等）。这些证据在后续的劳动仲裁或诉讼中将起到至关重要的作用。
书面通知用人单位：
- 员工应以书面形式向公司发出被迫解除劳动合同通知书，明确指出因公司克扣工资而依据法律规定提出解除劳动合同。为确保通知的有效性，建议通过邮政特快专递（EMS）发送，并在快递单上注明“被迫解除劳动合同通知书”字样，同时保留好快递回执作为证据。
主张经济补偿：
- 在被迫离职的同时，员工有权要求公司支付经济补偿。经济补偿的计算方式已在上文中详细说明，员工可以根据自己的工作年限和工资水平来计算应得的经济补偿金额。
寻求法律救济途径：
- 如果与公司就克扣工资及被迫离职相关事宜无法协商解决，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。同时，员工也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序来寻求最终的解决方案。
特殊情况说明
- 公司扣工资行为合法：
- 如果公司扣工资有合理原因，如代扣代缴个人所得税、社会保险费等法定项目，或者因员工自身过错导致公司经济损失而进行的合理扣除，这些行为不构成未及时足额支付劳动报酬。在此情况下，员工不能以公司扣工资为由申请被迫离职，也不能要求经济补偿。但员工仍有权要求公司说明扣款的具体原因和依据，并确保扣款的合法性和合理性。
示例说明
假设员工小张在公司工作了3年，月工资为5000元。因公司无故克扣小张2个月的工资共计10000元，小张决定提出被迫离职。根据法律规定，小张有权要求公司支付3个月工资作为经济补偿（即5000元/月 × 3月 = 15000元），并补发被克扣的10000元工资。
总结：公司克扣工资是违法行为，严重损害了员工的合法权益。员工在遭遇此类情况时，应依法维权，通过留存证据、书面通知公司、主张经济补偿以及寻求法律救济途径等方式来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。