结论：在车辆受损且双方同等责任的情况下，申请代位追偿后，一般无法追缴第二年保费增加的部分。以下从不同角度详细分析：

从代位追偿的法律性质角度

代位追偿是指因第三者对保险标的的损害而造成保险事故的，保险人自向被保险人赔偿保险金之日起，在赔偿金额范围内代位行使被保险人对第三者请求赔偿的权利。其本质是保险人为了防止被保险人获得双重赔偿，同时向有责任的第三方追偿以弥补自己的赔付损失。

在这个过程中，保险人行使代位追偿权是基于其与被保险人之间的保险合同关系以及法律的规定，主要目的是追偿已经支付给被保险人的赔偿款，并不涉及被保险人第二年保费的变化情况。第二年保费的增加是基于保险行业通行的费率调整规则，与代位追偿行为本身没有直接的因果关系。

从保险费率调整规则角度

保险公司调整车辆保险保费通常是依据多种因素，例如被保险车辆的历史出险次数、出险金额、车辆型号、车主年龄和驾驶经验等。当车辆在一年内出险后，保险公司会根据自身的费率体系，对下一年度的保费进行相应调整，出险次数越多、赔付金额越大，保费增加的可能性就越大。

这种费率调整是保险公司基于风险评估和经营成本考虑的商业行为，与代位追偿所涉及的追偿法律关系是相互独立的。即使被保险人通过代位追偿从第三方获得了一定赔偿，但这并不影响保险公司根据既定的费率规则对下一年度保费进行调整。

从实际操作和行业惯例角度

在保险行业的实际操作中，并没有将代位追偿与第二年保费调整相挂钩的惯例。保险公司在处理代位追偿案件时，主要关注的是如何从第三方那里追回已经支付给被保险人的赔偿款，以减少自身的损失。而对于被保险人第二年保费的调整，是按照公司统一的费率标准和流程进行，不会因为代位追偿的成功与否而改变。

例如，某车主的车辆在一年内发生了一次事故，双方同等责任，车主向自己的保险公司申请了代位追偿，保险公司赔付了相应的损失后向第三方追偿。在第二年续保时，保险公司仍然会根据该车辆上一年度的出险情况，按照公司的费率规则对保费进行调整，而不会考虑代位追偿所追回的金额。

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