超过效期的疫苗在疾控中心，一般不能直接让公司赔付，但具体是否可索赔需视情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、疫苗过期与责任主体
疾控中心的责任：
- 疾控中心作为疫苗的管理和分发机构，有责任确保疫苗在有效期内使用。如果疾控中心因管理疏忽导致过期疫苗被使用，疾控中心可能需要承担相应的行政责任或民事责任。但这并不直接等同于公司需要赔付。
公司的责任：
- 公司是否需要赔付，取决于其在疫苗供应链中的角色和责任。如果公司是疫苗的生产商或供应商，且因生产、储存或运输不当导致疫苗过期，那么公司可能需要承担相应的责任。但如果公司只是疫苗的购买者或使用者，且没有过错，则通常不需要赔付。
二、索赔的法律依据与途径
法律依据：
- 索赔的法律依据主要取决于具体的法律法规和合同条款。例如，如果因使用过期疫苗导致人身损害，受害者可以依据《民法典》中关于侵权责任的规定，向责任方主张赔偿。
- 如果涉及合同纠纷，如疫苗采购合同中明确规定了疫苗的有效期和质量标准，而供应商提供了过期疫苗，则购买方可以依据合同条款主张违约责任。
索赔途径：
- 如果认为疾控中心或公司存在过错，并导致了损失，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径来维护自己的权益。
- 在协商和调解无果的情况下，可以考虑向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
三、具体情境下的索赔可能性
如果公司是疫苗生产商或供应商：
- 若因公司原因导致疫苗过期，并造成了损失，那么公司可能需要承担赔偿责任。这包括因使用过期疫苗导致的人身损害赔偿，以及因合同违约导致的损失赔偿。
如果公司是疫苗购买者或使用者：
- 若公司没有过错，如已经按照合同要求验收了疫苗，并妥善储存，但疫苗仍因疾控中心或其他环节的原因过期，那么公司通常不需要承担赔付责任。此时，索赔应针对实际的责任方，如疾控中心或上游供应商。
四、建议与注意事项
- 保留证据：无论何种情况，都应保留好与疫苗相关的所有证据，包括采购合同、验收记录、储存条件记录、使用记录等。这些证据在后续的索赔过程中将起到关键作用。
- 及时咨询：如果因使用过期疫苗导致了损失，建议及时咨询专业律师，了解具体的索赔途径和法律依据。
- 注意时效：根据相关法律法规的规定，索赔请求可能受到诉讼时效的限制。因此，应在知道或应当知道权利受到侵害之日起的一定期限内（如三年）提起诉讼或申请仲裁。
如有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律意见。