冻结了公司的专用账户后，存在不能执行的情形主要包括以下几种：

1. 账户性质特殊且法律有明确保护规定：

   • 若公司专用账户属于法律明确规定不得冻结或执行的账户类型，如某些特定用途的专项资金账户（如社保基金账户、农民工工资专用账户等），则法院在执行过程中需遵循相关法律规定，不得对该类账户进行冻结或执行。这是因为这些账户的资金具有特定的用途和保护价值，冻结或执行可能损害公共利益或特定群体的合法权益。

2. 账户内资金不属于公司责任财产：

   • 如果账户内的资金并非公司所有，而是属于第三方所有（如信托资金、托管资金等），且该第三方对资金享有独立的财产权，那么法院在执行公司债务时，不得对该部分资金进行冻结或执行。这是因为执行行为应针对被执行人的责任财产，而不得侵犯第三方的合法权益。

3. 执行程序存在瑕疵或违法：

   • 在执行过程中，如果法院的执行行为存在程序瑕疵或违法情况，如未依法送达执行通知书、未听取被执行人陈述申辩等，被执行人可以提出执行异议，要求法院撤销或改正执行行为。在这种情况下，如果异议成立，法院可能会暂停或撤销对专用账户的冻结或执行。

4. 账户被其他法院先行冻结且存在轮候冻结情况：

   • 如果公司专用账户已被其他法院先行冻结，且存在轮候冻结的情况，那么在当前冻结法院未解除冻结或未处理完毕前，其他法院不得对该账户进行重复冻结或执行。这是为了保障执行程序的秩序和效率，避免多个法院对同一账户进行重复执行。

5. 公司进入破产程序：

   • 如果公司已经进入破产程序，那么根据破产法的规定，破产管理人将接管公司的财产和事务，包括专用账户。在这种情况下，法院不得再对专用账户进行冻结或执行，而应由破产管理人按照破产程序的规定对账户资金进行管理和分配。

针对以上情形，我给出以下法律建议：

• 对于公司而言，应定期审查专用账户的使用情况和资金性质，确保账户内资金符合法律规定和合同约定，避免因账户问题引发法律纠纷。
• 如果公司专用账户被冻结或面临执行风险，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，积极采取应对措施，如提出执行异议、申请复议等。
• 在与第三方进行业务合作时，应明确约定账户资金的所有权和使用权，避免因资金归属问题引发争议。

若您在公司法务方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。