结论前置：诉讼过程中原告公司主体注销，股东是否可以继续起诉需视具体情况而定。若公司未经依法清算即注销，股东可以作为原告继续诉讼；若公司已依法清算并注销，则原则上诉讼终结，但存在特殊情形时，股东仍可追究相关责任人的责任。
一、公司未经依法清算即注销的情况
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条，企业法人解散的，依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第二十条也规定，公司未经清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算，债权人主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任的，人民法院应依法予以支持。
股东行动建议：
- 在此情况下，股东可以作为原告继续诉讼，将被告变更为已注销公司的股东、发起人或者出资人等相关责任人。
- 股东需收集充分证据，如公司注销的证据、清算组未履行法定清算义务的证据等，以支持其诉讼请求。
可能法律后果：
- 相关责任人需对公司债务承担清偿责任，若他们曾作出书面承诺，则更需承担相应的法律责任。
二、公司已依法清算并注销的情况
法律效果：
- 公司完成清算程序并正式注销后，其法人资格消灭，民事权利能力和民事行为能力终止。原则上，公司不再作为适格的诉讼主体，法院会裁定终结诉讼。
特殊情况处理：
- 若存在清算组违法清算等特殊情形，如清算组在清算过程中存在故意或重大过失，损害了股东利益，股东可起诉清算组成员要求其承担相应赔偿责任。
- 股东需仔细审查清算报告和公告，若发现异常，可及时提起诉讼或申请调查。
股东行动建议：
- 在此情况下，股东应密切关注清算过程，确保清算程序合法合规。
- 若发现清算组存在违法行为，股东应及时收集证据并提起诉讼，以维护自身权益。
三、综合建议与注意事项
证据收集与准备：
- 无论公司是否依法清算，股东在提起诉讼前都应充分收集证据，如公司注销的证据、清算报告、财务报表、财产清单等，以支持其诉讼请求。
明确被告与诉讼请求：
- 股东需明确适格被告，可能是清算组成员、其他股东、公司实际控制人等。
- 诉讼请求需明确具体，如赔偿损失、返还财产、重新分配剩余财产等。
诉讼时效：
- 根据《民法典》，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害及义务人之日起计算。股东应及时行使权利，避免超过诉讼时效而丧失胜诉权。
预防措施：
- 在公司注销前，股东应积极参与清算过程，确保清算程序合法合规。
- 在公司注销后，股东应密切关注公司动态，及时发现并处理可能存在的法律问题。
若您在诉讼过程中遇到原告公司主体注销的情况，且不确定如何继续诉讼或维护自身权益，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。