结论概述：若您的店铺使用的是他人办理的营业执照，且该营业执照的持有人出现法律问题，您的店铺可能会面临一系列法律后果，包括但不限于行政处罚、民事责任以及可能的刑事责任。具体后果取决于营业执照持有人的违法行为性质、情节以及您与持有人之间的法律关系。
一、行政处罚风险
无照经营或借用营业执照的处罚：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》及相关规定，未经登记，以市场主体名义从事经营活动，或者借用、冒用他人营业执照从事经营活动的，由登记机关责令改正，没收违法所得；拒不改正的，处1万元以上10万元以下的罚款；情节严重的，依法责令关闭停业，并处10万元以上50万元以下的罚款。
- 若您的店铺实际经营但使用的是他人营业执照，可能被视为无照经营或借用营业执照，从而面临上述行政处罚。
协助违法行为的风险：
- 如果营业执照的持有人因违法行为被查处，而您作为实际经营者，若被认定为协助或参与其违法行为，也可能受到相应的行政处罚。
二、民事责任风险
合同责任：
- 若您的店铺以他人营业执照名义与第三方签订合同，且合同履行过程中出现问题，如违约、欺诈等，第三方可能依据合同向营业执照的持有人主张权利，而持有人可能转而向您追偿。
- 若营业执照持有人因违法行为导致第三方损失，且该损失与您的店铺经营有关，您也可能因共同侵权或连带责任而承担民事赔偿责任。
消费者权益保护责任：
- 若您的店铺在经营过程中侵害消费者权益，如销售假冒伪劣商品、提供虚假信息等，消费者可能依据《中华人民共和国消费者权益保护法》等规定，向营业执照的持有人主张权利，持有人可能因此向您追偿。
三、刑事责任风险
共同犯罪风险：
- 若营业执照的持有人因涉嫌犯罪被查处，而您作为实际经营者，若被认定为共同犯罪或协助犯罪，可能面临刑事指控和相应的刑事处罚。
- 例如，若持有人因销售假冒注册商标的商品罪被查处，而您作为实际销售者，若被认定为共同犯罪，可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑事处罚。
单位犯罪风险：
- 若您的店铺以他人营业执照名义经营，且该营业执照的持有人为单位（如公司），而单位因违法行为被认定为单位犯罪，您作为实际经营者或相关责任人员，也可能面临刑事责任。
建议与措施：
- 立即停止使用他人营业执照：为避免法律风险，您应立即停止使用他人营业执照进行经营活动，并尽快办理自己的营业执照。
- 与营业执照持有人协商解决：若已使用他人营业执照经营一段时间，且可能面临法律风险，建议您与营业执照持有人协商解决，明确双方责任和义务，避免后续纠纷。
- 咨询专业律师：针对具体情况，建议您咨询专业律师，了解具体法律风险和应对措施，以便更好地保护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。