公司将股东的借款转为实收资本，这一操作在法律上被称为“债转股”，是一种合法的资本运作方式。但是，为确保其合法性、合规性，必须严格遵循相关的法律程序与规定。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据
根据《公司法》及相关法律法规，股东可以以货币、实物、知识产权等非货币财产作价出资。借款转实收资本，实质为债权转股权，这一操作在法律上是被允许的，但需满足一定的条件。
二、操作流程与关键步骤
达成合意并签订协议：
- 首先，需要通过股东会决议，确保三分之二以上表决权的股东同意此操作。
- 接着，公司与股东需签订《债权转股权协议》，详细约定债权转股权的具体安排，包括借款金额、转股条件、转股价格等关键条款。
审计评估与验证：
- 聘请专业的会计师事务所进行财务审计，以验证借款的真实性。
- 如有必要，还需委托评估机构对债权价值进行评估，确保转股价格的公正合理。
公司章程修改与备案：
- 根据转股结果，修改公司章程中关于注册资本和股东出资的相关条款，并通过股东会审议。
- 向工商行政管理部门提交变更登记申请，包括股东会决议、修改后的公司章程、债权评估报告等必要文件。
通知债权人与利益保护：
- 正式通知公司所有债权人，保障其知情权与权益不受损害。
- 考虑特殊债权人的利益保护机制，以避免潜在纠纷。
税务处理与筹划：
- 根据税法规定，合理筹划企业所得税和个人所得税，避免不当税务风险。
三、风险防控与注意事项
债权真实性与合法性：
- 确保借款来源合法，无虚构债权，以避免法律风险。
- 防范因虚假债权转股被认定为抽逃出资等违法行为。
公司治理结构影响：
- 股权比例的变化将直接影响公司治理与决策机制。
- 股东应充分沟通，理解转股对公司治理的影响。
持续更新与登记：
- 更新公司财务报表，以反映转股后的资本结构变化。
- 及时办理工商变更登记，确保公司注册信息的准确性。
四、综合建议
债转股是一项复杂且敏感的操作，涉及法律、财务、税务等多个层面。为确保操作的顺利与合法，建议公司在实施前咨询专业的律师或会计师进行全面评估与规划。同时，公司应保持高度的透明度与合规性，确保所有操作均在法律框架内进行，以维护公司及股东的长远利益。
综上所述，公司将股东的借款转为实收资本是合法的，但需严格遵循相关法律程序与规定，并确保操作的合法性、合规性。