若打款时备注了已被查封的公司，需分情况处理，核心结论如下：
若打款行为发生在公司被查封前，且备注不影响款项性质
若款项支付时间早于法院查封裁定生效时间，且备注内容（如“货款”“投资款”等）与实际交易性质一致，则该打款行为本身不违法。但需注意：
- 查封效力：法院查封后，公司财产（包括银行账户）通常会被冻结，后续打入的款项可能被法院认定为查封财产范围，导致款项被扣划或无法支取。
- 风险防范：若已发现公司被查封，应立即停止后续打款，并核实查封范围（如是否包含目标账户），避免资金损失。
若打款行为发生在公司被查封后，可能涉及以下法律风险
- 协助逃避执行：若明知公司被查封仍向其账户打款，可能被认定为协助被执行人转移财产，面临《民事诉讼法》第114条规定的罚款、拘留，甚至刑事责任（《刑法》第313条拒不执行判决、裁定罪）。
- 款项无法追回：查封后打入的款项可能被法院直接扣划用于清偿债务，打款方难以通过民事途径主张返还（除非能证明款项与被执行人无关）。
- 合同效力问题：若打款基于与被查封公司的合同，需审查合同是否因查封而无法履行（如标的物被查封导致合同目的落空），可能涉及合同解除或违约责任。
紧急处理建议
- 立即联系法院：若已打款，应第一时间向执行法院说明情况，提供转账凭证、备注内容等证据，申请冻结款项或主张异议。
- 保留证据：保存合同、沟通记录、转账凭证等，证明款项性质（如借款、货款等）及自身无过错。
- 法律程序：若款项被错误扣划，可依据《民事诉讼法》第232条提出执行异议，或通过另案诉讼主张权利。
总结：打款备注被查封公司需高度谨慎，若已发生，应立即评估时间节点、款项性质及查封范围，通过法律程序最大限度维护权益。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。