针对您提出的“单位对于抑郁的员工怎么处理”这一问题，我会结合相关法律法规和实际案例，为您提供一个清晰、详细且有深度的解答。
首先，当员工被诊断为抑郁症并需要休病假时，单位应当给予充分的体恤和理解。根据员工的工龄和司龄，单位应按照国家规定给予相应的医疗期，并在医疗期内保障员工的基本工资和福利待遇不受明显影响。这是单位应尽的法律义务，也是体现人文关怀的重要方面。
然而，在处理抑郁员工病假期间的行为时，单位也需保持合理监督和管理的权利。以您提供的案例为例，S先生在休病假期间考取了心理学硕士并持续就读，同时公司在此期间为其发放了近40万元的工资、补贴和奖金。后来公司发现这一隐情后，认为S先生的行为严重违反了劳动纪律和诚实信用原则，并据此与其解除了劳动合同。
在这个案例中，我们可以看到几个关键点：
病假期间的合理行为：员工在病假期间应以恢复身体健康为主要目的，并遵医嘱安排自己的行为。如果员工在病假期间从事与病休无关且高强度的活动（如备考研究生），且未向公司披露或征得公司同意，这可能被视为违反劳动纪律和诚实信用原则。
单位的监督和管理权：单位在员工病假期间有权进行合理监督和管理，以确保员工的行为符合病休的目的和公司的规章制度。如果单位发现员工存在不当行为，有权采取相应的措施，包括解除劳动合同。
法律后果：如果员工的行为被认定为严重违反劳动纪律和诚实信用原则，单位有权解除劳动合同，并且员工可能需要退还病假期间超额发放的薪酬。在S先生的案例中，法院最终判决他向公司返还超额薪酬近20万元。
基于以上分析，对于单位如何处理抑郁员工的问题，我建议如下：
给予充分体恤和理解：在员工被诊断为抑郁症并需要休病假时，单位应给予充分的关心和支持，确保员工在医疗期内得到必要的休息和治疗。
保持合理监督和管理：单位应建立合理的监督和管理机制，确保员工在病假期间的行为符合病休的目的和公司的规章制度。如果发现员工存在不当行为，应及时进行沟通和处理。
依法处理违纪行为：如果员工的行为被认定为严重违反劳动纪律和诚实信用原则，单位应依法采取相应的措施，包括解除劳动合同和要求退还超额薪酬等。
加强沟通和教育：单位应加强与员工的沟通和教育，提高员工对病假期间行为规范的认识和理解，避免类似事件的发生。
总之，单位在处理抑郁员工问题时，应平衡好人文关怀和合理监督管理的关系，确保员工的合法权益得到保障的同时，也维护公司的正常运营和规章制度。