若纪委发现干部拥有50万现金存款且该干部不能说明合法来源，这通常会被认定为涉嫌违法违纪所得，并可能面临相应的纪律处分和法律责任。以下从几个角度进行详细分析：
一、纪律处分角度
违反廉洁纪律：
- 根据《中国共产党纪律处分条例》等相关规定，党员干部若不能说明其财产来源的合法性，且数额较大，很可能被视为违反廉洁纪律的行为。这种行为损害了党员干部的形象和公信力，破坏了党的纪律和规矩。
- 纪律处分可能包括警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看或开除党籍等，具体取决于情节的严重程度和干部的认错态度等因素。
涉嫌贪污受贿：
- 如果这50万现金存款被证实为贪污、受贿等违法所得，那么该干部将面临更严重的纪律处分，甚至可能被移送司法机关处理。
- 贪污受贿是严重的违法犯罪行为，不仅违反了党的纪律，也触犯了刑法，将受到法律的严惩。
二、法律责任角度
巨额财产来源不明罪：
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百九十五条的规定，国家工作人员的财产、支出明显超过合法收入，差额巨大的，可以责令该国家工作人员说明来源，不能说明来源的，差额部分以非法所得论，处五年以下有期徒刑或者拘役；差额特别巨大的，处五年以上十年以下有期徒刑。财产的差额部分予以追缴。
- 在本案例中，如果干部不能说明50万现金存款的合法来源，且差额巨大，那么该干部可能构成巨额财产来源不明罪，将面临刑事处罚。
其他相关犯罪：
- 除了巨额财产来源不明罪外，如果这50万现金存款与贪污、受贿、挪用公款等其他犯罪行为有关，那么该干部还可能面临其他相关犯罪的指控和处罚。
三、实际处理中的考量因素
证据收集与审查：
- 纪委在调查过程中会注重证据的收集和审查，包括干部的财产申报情况、银行流水记录、相关证人证言等。只有确凿的证据才能支持对干部的纪律处分或法律追究。
干部的态度与配合程度：
- 干部在调查过程中的态度和配合程度也会影响处理结果。如果干部能够积极配合调查，如实说明情况，可能在一定程度上减轻处分或处罚。相反，如果干部拒不配合或隐瞒事实，将可能面临更严重的后果。
社会影响与舆论关注：
- 此类案件往往会引起社会广泛关注和舆论热议。纪委在处理过程中会充分考虑社会影响和舆论关注，确保处理结果的公正性和合理性。
建议：对于涉及此类问题的干部，应尽快向纪委说明情况，配合调查，并寻求专业法律帮助以维护自身合法权益。同时，也提醒广大党员干部要严格遵守党的纪律和规矩，廉洁自律，避免陷入类似的法律困境。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。